胚胎后Oct4重新表达范式：E7诱导的羟甲基化调控宫颈癌中Oct4表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248367

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数据说明

八聚体结合转录因子4（Oct4）在多种恶性肿瘤中表达上调，然而关于Oct4在胚胎期后重新表达的机制范式尚缺乏充分认识。在宫颈癌中，HPV相关宫颈癌的Oct4表达高于非HPV相关宫颈癌，且这种上调与E7癌基因的表达相关。我们曾报道E7影响宫颈癌中Oct4的转录输出及Oct4相关表型，但其潜在机制仍不明确。在此，我们对宫颈癌细胞中Oct4的蛋白相互作用进行了表征，并揭示甲基结合蛋白（MBD2和MBD3）是Oct4驱动转录的决定因素。E7触发MBD2下调和TET1上调，从而破坏Oct4基因的甲基化状态。这与总DNA羟甲基化水平的升高相吻合，导致Oct4在宫颈癌中重新表达，并可能影响更广泛的转录模式。

我们的发现揭示了一种此前未报道的机制，即E7癌基因可通过增加DNA羟甲基化并降低癌变过程中细胞可塑性的障碍来调控转录。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。