人类DUS酶介导的细胞类型特异性翻译调控数据集（tRNA NaBH4）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE246816

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

二氢尿苷是一种丰富且进化保守的修饰核苷，存在于tRNA上，但哺乳动物中单个修饰位点及相关DUS写入酶的特征和功能研究仍缺乏。本研究采用化学探针策略RNABPP-PS，鉴定出5-氯尿苷可作为人DUS酶的通用活性探针。我们通过基于机制的RNA-蛋白质交联以及化学反应性和突变谱分析来定位D修饰，揭示了人tRNA上D修饰位点的图谱。此外，我们在两种人细胞系模型中敲除单个DUS基因，以研究其对tRNA表达水平和密码子特异性翻译延伸的调控。我们发现，尽管D修饰存在于大多数tRNA种类中，但D的缺失仅以细胞类型特异性的方式扰动一部分tRNA的翻译功能。我们的工作为研究多样生物系统中的D和DUS酶提供了有力的化学策略，并为一种普遍存在的tRNA修饰在翻译调控中的作用提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。