TET1通过调控自噬抑制宫颈癌细胞迁移和侵袭 [MeDIP-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE236315

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

甲基化修饰在调控基因表达和多种生物学过程中发挥着重要作用。去甲基化修饰因子TET1的沉默可影响关键癌基因或抑癌基因的表达，从而促进肿瘤形成。然而，TET1如何影响宫颈癌的进展尚待阐明。在本研究中，我们发现TET1在宫颈癌组织中的表达显著下调。在功能上，敲低宫颈癌细胞中的TET1可促进细胞增殖、迁移、侵袭、宫颈异种移植瘤形成及EMT。相反，其过表达则可逆转上述过程。此外，敲低TET1后宫颈癌细胞的自噬水平可增强。在机制上，甲基化DNA免疫沉淀（MeDIP）测序和MeDIP定量实时PCR揭示，TET1介导自噬启动子区域的甲基化。

这些发现提示，TET1通过改变自噬基因NKRF和HIST1H2AK的甲基化水平影响宫颈癌细胞的恶性生物学行为，但具体机制尚需进一步研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。