人类转录组与蛋白质组稳定参考的多组学数据集

资源简介

人类转录组与蛋白质组稳定参考的多组学数据集

GSE234201 是一个来自 NCBI 的多组学数据集，其标题为“A multi-omics dataset of human transcriptome and proteome stable reference”，即人类转录组与蛋白质组稳定参考的多组学数据集。该数据集在本站被归类于肿瘤 / 宫颈癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。根据源站描述，该研究的核心目标是通过比较 5 个细胞系第 9 至 12 代转录组的基因表达定量，寻找最稳定的细胞系。数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE234201_series_matrix.txt.gz。作者为 Gong 和 Zhang，发布时间为 Jun 05 202。主题标签涉及高通量测序表达谱分析，并标注了 GPL23227 与 9606。整体而言，该数据集围绕人类转录组与蛋白质组稳定参考的建立，提供了可用于评估细胞系稳定性的多组学资源。

【数据集背景】

该数据集的主题为人类转录组与蛋白质组稳定参考，属于多组学数据范畴。源站描述指出，研究的出发点是寻找最稳定的细胞系，具体方式是比较 5 个细胞系第 9 至 12 代转录组的基因表达定量。本站将其归类于肿瘤 / 宫颈癌，说明该数据集可能与肿瘤或宫颈癌相关研究背景存在关联。数据集由 Gong 和 Zhang 两位作者完成，发布时间为 Jun 05 202。主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”，表明数据通过高通量测序技术获取表达谱信息；同时标注了 GPL23227 和 9606，分别对应平台与物种层面的标识信息。整体来看，该数据集旨在为转录组与蛋白质组研究提供稳定参考，并通过多代细胞系的表达定量比较来筛选稳定性最佳的细胞系。

【数据内容】

该数据集的文件数量为 1，文件样例为 GSE234201_series_matrix.txt.gz。从文件名称来看，该文件应为系列矩阵文件，并以 GZIP 压缩格式提供。源站描述提到，数据内容涉及 5 个细胞系第 9 至 12 代转录组的基因表达定量。这意味着数据可能包含这些细胞系在不同代次下的表达定量结果，用于比较不同细胞系之间的稳定性。主题标签中的“Expression profiling by high throughput sequencing”进一步说明，这些表达定量数据是通过高通量测序获得的。本站分类为肿瘤 / 宫颈癌，提示该数据集可能适用于肿瘤或宫颈癌相关研究。除上述信息外，关于数据的具体字段、样本数量、基因数量、蛋白质组数据细节等，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站标题为“A multi-omics dataset of human transcriptome and proteome stable reference”。作者为 Gong 和 Zhang，发布时间为 Jun 05 202。数据通过高通量测序获取表达谱信息，主题标签中明确标注了“Expression profiling by high throughput sequencing”。平台标识为 GPL23227，物种标识为 9606。源站描述指出，研究通过比较 5 个细胞系第 9 至 12 代转录组的基因表达定量，来寻找最稳定的细胞系。关于样本采集的具体流程、细胞系来源、培养条件、测序平台细节、蛋白质组数据采集方式等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要评估细胞系稳定性的研究场景，尤其是涉及转录组表达定量比较的分析。由于研究比较了 5 个细胞系第 9 至 12 代的基因表达定量，因此可用于探索不同细胞系在连续传代过程中的表达稳定性，进而为选择稳定参考细胞系提供依据。本站分类为肿瘤 / 宫颈癌，提示该数据集可能适用于肿瘤或宫颈癌相关的基础研究、方法学开发或参考材料筛选。主题标签中的高通量测序表达谱分析表明，该数据集可用于转录组层面的表达谱研究。此外，由于标题提及多组学，该数据集也可能与蛋白质组稳定参考相关，但源站描述主要聚焦于转录组比较。关于具体适用场景的更多细节，源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时，可下载数据文件 GSE234201_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，需按相应格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。由于文件为系列矩阵格式，通常可用于提取表达定量信息并进行后续分析。在分析过程中，可结合源站描述的研究目标，比较 5 个细胞系第 9 至 12 代的基因表达定量，以评估细胞系稳定性。关于具体的分析流程、软件工具、参数设置等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的文件数量为 1，文件样例为 GSE234201_series_matrix.txt.gz。源站描述仅提及通过比较 5 个细胞系第 9 至 12 代转录组的基因表达定量来寻找最稳定的细胞系，未提供关于数据质量评估、重复性、批次效应、缺失值处理等方面的信息。主题标签中标注了 GPL23227 和 9606，但未说明平台的具体性能或物种注释的详细程度。本站分类为肿瘤 / 宫颈癌，但源站描述未明确说明该分类的依据。关于数据的局限性、适用范围限制、技术偏差等，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Gong 和 Zhang，发布时间为 Jun 05 202。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用方式、许可协议、使用限制等，源站未提供。