HPV18致癌分子机制转录组测序分析数据集
该数据集来自NCBI GEO，聚焦HPV18致癌分子机制研究。研究者采用条件重编程技术培养正常宫颈上皮细胞、宫颈上皮内瘤变HPV18细胞及患者来源宫颈癌细胞系，经雌二醇刺激后收集总RNA进行mRNA测序，并对六组细胞的RNA-seq数据进行基因表达谱分析
基本信息
资源简介
HPV18致癌分子机制转录组测序分析数据集
Analysis of molecular mechanism of HPV18 carcinogenesis by transcriptome sequencing
该数据集来自NCBI GEO，聚焦HPV18致癌分子机制研究。研究者采用条件重编程技术培养正常宫颈上皮细胞、宫颈上皮内瘤变HPV18细胞及患者来源宫颈癌细胞系，经雌二醇刺激后收集总RNA进行mRNA测序，并对六组细胞的RNA-seq数据进行基因表达谱分析。数据包含1个文件，可用于宫颈癌发生发展相关基因表达模式与分子机制探索（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jun 02 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为研究HPV18致癌的分子机制，我们采用条件重编程技术培养正常宫颈上皮细胞、宫颈上皮内瘤变HPV18细胞及患者来源的宫颈癌细胞系24小时，并用雌二醇刺激24小时，收集总RNA样本进行mRNA测序（RNA-SEQ）。随后，利用六组细胞的RNA-seq数据进行基因表达谱分析。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE234041
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 01 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
为研究HPV18致癌的分子机制，我们采用条件重编程技术培养正常宫颈上皮细胞、宫颈上皮内瘤变HPV18细胞及患者来源的宫颈癌细胞系24小时，并以雌二醇刺激24小时，收集总RNA样本进行mRNA测序（RNA-SEQ）。随后，利用六组细胞的RNA-seq数据进行基因表达谱分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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