转录-复制冲突决定PARP抑制剂敏感性数据集
该数据集来自NCBI GEO（GSE220223），聚焦转录-复制冲突对PARP抑制剂敏感性的影响。数据通过EdUseq在HeLa细胞中检测TIMELESS或TIPIN敲低后的复制叉进程，细胞经胸苷同步化后于S期释放120分钟，最后30分钟标记EdU
基本信息
资源简介
转录-复制冲突决定PARP抑制剂敏感性数据集
Transcription–replication conflicts underlie sensitivity to PARP inhibitors
该数据集来自NCBI GEO（GSE220223），聚焦转录-复制冲突对PARP抑制剂敏感性的影响。数据通过EdUseq在HeLa细胞中检测TIMELESS或TIPIN敲低后的复制叉进程，细胞经胸苷同步化后于S期释放120分钟，最后30分钟标记EdU。数据集包含1个文件（GSE220223_series_matrix.txt.gz），主题标签涉及Other、GPL20301和9606。可用于研究转录-复制冲突机制及PARP抑制剂敏感性的预测分析（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Dec 06 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为了检测TIMELESS/TIPIN敲低后复制叉起始进程，在转染siCTRL、siTIMELESS或siTIPIN的HeLa细胞中进行EdUseq，用胸苷同步化后于S期释放120分钟，最后30分钟用EdU标记。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Other、GPL20301、9606。本站分类：肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE220223
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 16 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE220223
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为检测TIMELESS/TIPIN敲低后复制叉行进及起始情况，对转染siCTRL、siTIMELESS或siTIPIN的HeLa细胞进行EdUseq，细胞经胸苷同步化后于S期释放120分钟，其中最后30分钟用EdU标记。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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