GSE215288：LGALS1 在 HeLa 细胞中通过综合调控转录组谱在宫颈癌中发挥抑癌作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE215288

标准获取流程：

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

长链非编码RNA(lncRNA)作为多种癌症发生发展的关键调控因子已被广泛研究。是近年来新发现的一种lncRNA，多项研究表明在不同癌症中可能发挥致癌或抑癌作用。泛癌分析显示，高表达与较好的预后显著相关。然而，在宫颈癌发生发展中的作用尚不清楚。在本研究中，我们在HeLa细胞系中构建了过表达模型。我们发现过表达显著抑制细胞增殖并诱导细胞凋亡，***可能是宫颈癌中的一种新型抑癌因子。机制上，***过表达可激活I型干扰素信号通路并抑制DNA损伤应答相关基因的表达。同时，可调控大量RNA结合蛋白基因的表达，从而可能影响参与细胞增殖或凋亡调控基因的可变剪接。我们还构建了ceRNA网络，以预测通过miRNA对基因表达的调控作用。

我们的研究强调了lncRNA ***在宫颈癌发展中的关键作用，并提示了潜在的调控机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。