HeLa细胞中RBM39依赖的可变剪接事件鉴定

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HeLa细胞中RBM39依赖的可变剪接事件鉴定

GSE202134 数据集来自 NCBI GEO，标题为“Identification of RBM39-dependent alternative splicing events in HeLa cells”，即 HeLa 细胞中 RBM39 依赖的可变剪接事件鉴定。该数据集属于肿瘤 / 宫颈癌分类，围绕 RBM39 敲低与回补后 HeLa 细胞中基因表达和可变剪接的变化展开，采用高通量测序表达谱分析手段。数据集由 Daniel Jutzi 提交，发布时间为 May 03 202，包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE202134_series_matrix.txt.gz。整体而言，该数据集为研究 RBM39 在宫颈癌细胞转录后调控中的作用提供了表达谱与可变剪接层面的数据基础。

【数据集背景】

RBM39 是一种 RNA 结合蛋白，参与转录后调控过程。该数据集聚焦于 HeLa 细胞这一宫颈癌细胞模型，旨在鉴定 RBM39 依赖的可变剪接事件。源站描述指出，该研究对 RBM39 缺失及回补后 HeLa 细胞中基因表达和可变剪接的改变进行了全面分析。数据集归入肿瘤 / 宫颈癌分类，说明其应用背景与宫颈癌相关的肿瘤生物学研究相关。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE202134_series_matrix.txt.gz，属于高通量测序表达谱数据。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL21290 和 9606，分别对应高通量测序表达谱、芯片平台编号与人类物种编号。数据内容对应 RBM39 敲低与回补条件下 HeLa 细胞的基因表达与可变剪接变化信息。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库。源站标题与数据集英文名一致，均为“Identification of RBM39-dependent alternative splicing events in HeLa cells”。作者为 Daniel Jutzi，发布时间为 May 03 202。数据通过高通量测序表达谱分析获得，平台信息以 GPL21290 标识，物种为 9606（人类）。

【适用场景】

该数据集适用于研究 RBM39 依赖的可变剪接事件，以及 RBM39 缺失与回补对 HeLa 细胞基因表达和可变剪接的影响。由于归类为肿瘤 / 宫颈癌，可用于宫颈癌相关转录后调控与剪接调控的探索性分析。其高通量测序表达谱属性使其适合作为基因表达与剪接变化分析的输入数据。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE202134_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以保证后续分析的准确性。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。