缺氧人成体真皮成纤维细胞条件培养基对宫颈癌细胞的增强抗癌效应 [dataset 1]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE185978

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

缺氧通过改变细胞内信号传导和分泌因子来调节成纤维细胞功能，从而影响邻近细胞的状态。在本研究中，我们探究了在常氧和缺氧条件下培养的人成体真皮成纤维细胞（HDFs）条件培养基（CM）对宫颈癌细胞（HeLa）的影响。与常氧培养HDFs的条件培养基（N-CM）相比，缺氧培养HDFs的条件培养基（H-CM）使HeLa细胞活力下降、凋亡增加并发生细胞周期阻滞。在H-CM相较于N-CM上调（> 2倍）的蛋白质中，LTBR降低了HeLa细胞的活力。在H-CM相较于N-CM处理的HeLa细胞中下调（> 2倍）的细胞内蛋白质中，富集程度最高的生物学过程GO术语和KEGG通路分别为蛋白质去泛素化和hsa05166：HTLV-I感染。在表达改变（> 2倍）的细胞内蛋白质的蛋白质-蛋白质相互作用网络中，确定了1个上调（TNF）和8个下调（ESR1、MCL1、TBP、CD19、LCK、PCNA、CHEK1和POLA1）枢纽蛋白。

在表达下调的枢纽蛋白中，最富集的生物学过程GO术语和KEGG通路分别是前导链延伸和hsa05166：HTLV-I感染。本研究表明，与N-CM相比，H-CM对宫颈癌细胞具有增强的抗癌效果，并且它诱导了与这些增强抗癌效果相关的细胞内信号传导模式。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。