Hela细胞缺氧条件下sgSETDB1的总RNA转录组分析
该数据集来自NCBI GEO,标题为Hela细胞缺氧条件下sgSETDB1的总RNA转录组分析,属于肿瘤/宫颈癌分类。研究目的是比较缺氧条件下携带sgSETDB1与shcontrol的Hela细胞的NGS转录组谱与qRT-PCR方法,可用于宫颈癌缺氧相关基因表达及SETDB1功能研究(来源 NCBI

基本信息
资源简介
Hela细胞缺氧条件下sgSETDB1的总RNA转录组分析
Total RNA transcriptome analysis of hypoxia with sgSETDB1 in hela cells
该数据集来自NCBI GEO,标题为Hela细胞缺氧条件下sgSETDB1的总RNA转录组分析,属于肿瘤/宫颈癌分类。数据包含1个文件(GSE179329_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序进行非编码RNA分析,平台为GPL11154,物种为9606(人)。研究目的是比较缺氧条件下携带sgSETDB1与shcontrol的Hela细胞的NGS转录组谱与qRT-PCR方法,可用于宫颈癌缺氧相关基因表达及SETDB1功能研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 02 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:本研究的目的是比较缺氧条件下携带sgSETDB1和shcontrol的Hela细胞的NGS衍生转录组谱(RNA-seq)与定量逆转录聚合酶链反应(qRT–PCR)方法。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE179329
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 15 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
目的:本研究的目标是在缺氧转录组分析(RNA-seq)中,比较由NGS获得的、分别带有sgSETDB1和shcontrol的Hela细胞,并与定量逆转录聚合酶链反应(qRT–PCR)方法进行比较。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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