HIF-3α诱导的miR-630表达通过形成正反馈环路促进宫颈癌细胞癌症特征

该数据集来自NCBI GEO,标题为HIF-3α诱导的miR-630表达通过形成正反馈环路促进宫颈癌细胞癌症特征,属于肿瘤/宫颈癌分类

geo
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基因组分类GPL185739606
GSE158532: HIF-3α-induced miR-630 expression promotes cancer hallmarks in cervical cancer cells by forming a positive feedback loop

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

HIF-3α诱导的miR-630表达通过形成正反馈环路促进宫颈癌细胞癌症特征

GSE158532 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,标题为“HIF-3α-induced miR-630 expression promotes cancer hallmarks in cervical cancer cells by forming a positive feedback loop”,即 HIF-3α 诱导的 miR-630 表达通过形成正反馈环路促进宫颈癌细胞的癌症特征。该数据集归属于肿瘤 / 宫颈癌分类,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人(9606),平台编号为 GPL18573。数据集由作者 dong、chen 提交,发布时间为 Sep 24 202,包含 1 个文件,样例文件为 GSE158532_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集围绕宫颈癌细胞中 HIF-3α、miR-630 与癌症特征之间的调控关系展开,适合用于相关表达谱的查阅与二次分析。

【数据集背景】

该数据集的研究主题聚焦于宫颈癌细胞的分子机制。标题明确指出,HIF-3α 诱导的 miR-630 表达通过形成正反馈环路促进宫颈癌细胞的癌症特征(cancer hallmarks)。这一主题属于肿瘤学中关于转录因子、微小 RNA 与肿瘤表型之间相互作用的研究范畴。数据集来源于 NCBI GEO,源站描述说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,表明其组织方式为系列集合形式。本站将其归类为肿瘤 / 宫颈癌,便于在肿瘤相关数据资源中定位。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE158532_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩包格式。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL18573 和 9606,分别对应高通量测序表达谱、芯片平台编号与人源物种标识。源站描述仅说明该 SuperSeries 由所列 SubSeries 组成,未提供更细的样本数量、分组信息或具体基因列表。数据内容的具体字段构成需以实际文件为准。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。作者为 dong、chen,发布时间为 Sep 24 202。物种为人(9606),平台为 GPL18573。源站描述指出该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,但未提供各 SubSeries 的具体名称与内容。采集方法、实验设计细节及样本处理流程源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于宫颈癌相关表达谱的查阅与比较分析,可用于关注 HIF-3α 与 miR-630 调控关系、正反馈环路以及癌症特征相关基因表达变化的研究场景。由于采用高通量测序表达谱,也可作为肿瘤分子机制研究中表达数据整合与验证的参考来源。具体分析目标应结合文件实际内容确定。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE158532_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段格式或编码问题导致解析错误。由于文件为系列矩阵形式,读取后应检查行列表头与样本标识是否完整,再开展后续分析。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1,源站描述较为简略,仅说明 SuperSeries 由 SubSeries 组成,未提供样本量、重复数、质控指标等细节。发布时间标注为 Sep 24 202,年份信息不完整。使用时应以实际文件内容和源站页面为准,注意 SuperSeries 与 SubSeries 之间的层级关系,避免重复或遗漏。其余质量相关信息源站未提供。

【引用与许可】

引用时应参考源站标题与作者信息(dong、chen),并注明数据来自 NCBI GEO,编号 GSE158532。许可信息源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE158532

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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