HIF-3α诱导的miR-630表达通过正反馈环路促进宫颈癌细胞癌症标志 [miRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE158531

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

缺氧在宫颈癌的发展和转移中具有关键作用，其通过诱导包括microRNA基因在内的众多基因的表达水平而发挥作用。然而，我们对于缺氧因子和microRNA如何协同调控宫颈癌细胞的标志性特征知之甚少。在此，我们发现缺氧诱导的过表达HIF-3α增加了数十种miRNA的表达，包括miR-630。在HeLa细胞中稳定过表达miR-630可促进癌症标志性特征，包括放射抵抗、凋亡抑制、迁移和侵袭增加以及EMT介导的转移。稳定抑制miR-630则表现出相反的特征。进一步实验表明，miR-630的激活由缺氧处理诱导。在分子机制方面，我们采用RNA测序（RNA-seq）和染色质免疫沉淀测序实验（ChIP-seq）研究HIF-3α的靶标。我们发现缺氧诱导HIF-3α的表达，通过直接结合miR-630的启动子来激活其表达。同时，miR-630正向调控HIF-1α的表达，但抑制HIF-1α。

综上所述，我们的研究结果揭示了一个新的缺氧诱导的HIF3a-miR-630调节反馈环路，该环路促进宫颈癌细胞的转移和进展，并提示HIF3a和miR-630可能作为宫颈癌的潜在生物标志物和治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。