PCIF1敲低对HeLa S3细胞基因表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE156768

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们此前已将PCIF1（磷酸化CTD相互作用因子1）鉴定为RNA聚合酶II的一种新型磷酸化C端结构域（CTD）结合蛋白。我们最近还将PCIF1鉴定为一种新的帽特异性腺嘌呤N6甲基转移酶（CAPAM），负责在mRNA的5’端生成N6,2’-O-二甲基腺苷（m6Am）。然而，PCIF1如何调控基因表达仍不清楚。为鉴定在人类培养细胞中表达水平受PCIF1敲低影响的基因，我们通过微阵列分析进行了基因表达谱分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。