GSE124530:整合microRNA结合与靶基因表达数据预测功能性microRNA靶点
该数据集来自NCBI GEO,包含一项大规模RNA测序研究,用于实验鉴定被25个microRNA下调的基因。数据将RNA-seq结果与公开的microRNA靶结合数据结合,系统识别同时具有microRNA结合和靶基因下调特征的microRNA靶向特征,并通过机器学习框架整合这些特征,开发并验证改进的

基本信息
资源简介
GSE124530:整合microRNA结合与靶基因表达数据预测功能性microRNA靶点
Prediction of functional microRNA targets by integrative modeling of microRNA binding and target expression data
该数据集来自NCBI GEO,包含一项大规模RNA测序研究,用于实验鉴定被25个microRNA下调的基因。数据将RNA-seq结果与公开的microRNA靶结合数据结合,系统识别同时具有microRNA结合和靶基因下调特征的microRNA靶向特征,并通过机器学习框架整合这些特征,开发并验证改进的全基因组microRNA靶点预测计算模型。所有预测数据可在miRDB获取。该数据集可用于microRNA功能靶点预测建模及宫颈癌相关研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 01 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们开展了一项大规模RNA测序研究,以实验方式鉴定被25个microRNA下调的基因。该RNA-seq数据集与公开的microRNA靶结合数据相结合,以系统识别同时具有microRNA结合和靶基因下调特征的microRNA靶向特征。通过在机器学习框架中整合这些共同特征,我们开发并验证了一个改进的全基因组microRNA靶点预测计算模型。所有预测数据可在miRDB(
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL21290、9606。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE124530
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 24 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE124530
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们进行了一项大规模的RNA测序研究,以实验方式识别被25种miRNA下调的基因。此RNA-seq数据集与公开的miRNA靶标结合数据相结合,系统性地鉴定了既具有miRNA结合特征又导致靶标下调的miRNA靶向特性。通过在一个机器学习框架中整合这些共同特征,我们开发并验证了一个改进的计算模型,用于全基因组miRNA靶标预测。所有预测数据可在miRDB(http://mirdb.org)获取。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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