GSE124530:整合microRNA结合与靶基因表达数据预测功能性microRNA靶点

该数据集来自NCBI GEO,包含一项大规模RNA测序研究,用于实验鉴定被25个microRNA下调的基因。数据将RNA-seq结果与公开的microRNA靶结合数据结合,系统识别同时具有microRNA结合和靶基因下调特征的microRNA靶向特征,并通过机器学习框架整合这些特征,开发并验证改进的

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基因组预测GPL212909606
GSE124530: Prediction of functional microRNA targets by integrative modeling of microRNA binding and target expression data

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

GSE124530:整合microRNA结合与靶基因表达数据预测功能性microRNA靶点

Prediction of functional microRNA targets by integrative modeling of microRNA binding and target expression data

该数据集来自NCBI GEO,包含一项大规模RNA测序研究,用于实验鉴定被25个microRNA下调的基因。数据将RNA-seq结果与公开的microRNA靶结合数据结合,系统识别同时具有microRNA结合和靶基因下调特征的microRNA靶向特征,并通过机器学习框架整合这些特征,开发并验证改进的全基因组microRNA靶点预测计算模型。所有预测数据可在miRDB获取。该数据集可用于microRNA功能靶点预测建模及宫颈癌相关研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 01 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们开展了一项大规模RNA测序研究,以实验方式鉴定被25个microRNA下调的基因。该RNA-seq数据集与公开的microRNA靶结合数据相结合,以系统识别同时具有microRNA结合和靶基因下调特征的microRNA靶向特征。通过在机器学习框架中整合这些共同特征,我们开发并验证了一个改进的全基因组microRNA靶点预测计算模型。所有预测数据可在miRDB(

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21290、9606。本站分类:肿瘤/宫颈癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE124530

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 24 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE124530

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们进行了一项大规模的RNA测序研究,以实验方式识别被25种miRNA下调的基因。此RNA-seq数据集与公开的miRNA靶标结合数据相结合,系统性地鉴定了既具有miRNA结合特征又导致靶标下调的miRNA靶向特性。通过在一个机器学习框架中整合这些共同特征,我们开发并验证了一个改进的计算模型,用于全基因组miRNA靶标预测。所有预测数据可在miRDB(http://mirdb.org)获取。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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