GSE113171：环境应激下多层调控图谱
该数据集来自 NCBI GEO，标题为 Mapping multi-layered regulation in response to environmental stress，聚焦宫颈癌细胞在 tunicamycin 处理下 8 小时时间进程中的转录与蛋白浓度变化，并补充核糖体与非核糖体蛋白的 R
基本信息
资源简介
GSE113171：环境应激下多层调控图谱
Mapping multi-layered regulation in response to environmental stress
该数据集来自 NCBI GEO，标题为 Mapping multi-layered regulation in response to environmental stress，聚焦宫颈癌细胞在 tunicamycin 处理下 8 小时时间进程中的转录与蛋白浓度变化，并补充核糖体与非核糖体蛋白的 RNA footprints，用于解析翻译及反式因子结合变化。数据包含 1 个文件 GSE113171_series_matrix.txt.gz，主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL16791 平台和 9606 物种。可用于研究内质网应激与氧化应激等条件下信号通路在转录和翻译层面的时间依赖性调控（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Apr 16 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们绘制了宫颈癌细胞在 tunicamycin 处理下 8 小时时间进程中转录本和蛋白质浓度的变化图谱。我们通过核糖体和非核糖体蛋白的 RNA footprints 补充该数据集，以确定翻译和反式因子结合的变化。本研究的目标是揭示在内质网应激和氧化应激等不同应激条件下，信号通路在转录和翻译层面随时间变化的复杂性。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL16791、9606。本站分类：肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE113171
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 27 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE113171
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们绘制了在衣霉素处理下，宫颈癌细胞在八小时时间过程中的转录本和蛋白质浓度变化图谱。我们通过核糖体及非核糖体蛋白的RNA足迹来补充这一数据集，以确定翻译和反式因子结合的变化。本研究旨在揭示在内质网应激和氧化应激等不同应激条件下，信号传导通路在转录和翻译层面随时间变化的复杂性。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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