宫颈癌 HeLa 细胞糖酵解振荡数据集
该数据集为宫颈癌 HeLa 细胞糖酵解振荡研究的原始数据,对应论文 Figure 1。HeLa 细胞先在生长培养基中培养,随后进行 24 小时葡萄糖饥饿处理,培养条件为 5% CO2、37 °C 及饱和湿度

基本信息
资源简介
宫颈癌 HeLa 细胞糖酵解振荡数据集
该数据集名为 Glycolytic oscillations in cervical cancer HeLa cells,聚焦于宫颈癌 HeLa 细胞在葡萄糖饥饿条件下的糖酵解振荡现象,属于肿瘤/宫颈癌研究范畴。数据集来源于 doi.org,由 Lancaster University 的 Stefanovska, Aneta 与 Rowland Adams, Joe 于 2020 年发布,采用 CC BY 许可。其内容为论文 Figure 1 所展示的原始数据,记录了 HeLa 细胞在生长培养基中培养后,经 24 小时葡萄糖饥饿处理,在 5% CO2、37 °C 及饱和湿度条件下所表现出的典型糖酵解振荡。主题标签涵盖 glycolysis、oscillations、cancer、HeLa cells、NADH 与 time series,适合用于细胞代谢动态、肿瘤代谢重编程及相关时间序列分析研究。
【数据集背景】
该数据集对应宫颈癌 HeLa 细胞糖酵解振荡研究中的原始数据,具体为相关论文 Figure 1 所展示的内容。HeLa 细胞是一种常用的宫颈癌细胞系,在肿瘤代谢研究中具有代表性。糖酵解振荡是细胞代谢动态的重要表现,涉及 NADH 等关键代谢物的周期性变化。该数据集围绕葡萄糖饥饿条件下 HeLa 细胞的糖酵解振荡展开,旨在为观察单个 HeLa 宫颈癌细胞中的糖酵解振荡提供原始数据支撑。相关研究发表于 Chaos 期刊,论文题为 Primordial oscillations in life direct observation of glycolytic oscillations in individual hela cervical cancer cells,作者包括 Takashi Amemiya、Kenichi Shibata、Yoshihiro Itoh、Kiminori Itoh、Masatoshi Watanabe 与 Tomohiko Yamaguchi,发表于 2017 年。
【数据内容】
数据集包含两个典型糖酵解振荡数据文件,分别为 ’data FBS+Glc-.csv’ 和 ’data FBS-Glc-.csv’。前者对应葡萄糖饥饿但保留 FBS 条件下 HeLa 细胞的典型糖酵解振荡数据,后者对应同时进行葡萄糖饥饿与 FBS 饥饿条件下 HeLa 细胞的典型糖酵解振荡数据。数据以时间序列形式呈现,主题标签中包含 NADH,表明数据可能与 NADH 相关的代谢振荡信号有关。除上述两个文件名及其对应条件外,源站未提供更详细的数据字段、采样频率、记录时长或具体数值范围。
【采集与来源】
HeLa 细胞先在生长培养基中培养,生长培养基由 89% 高糖 DMEM、10% FBS 和 1% 抗生素-抗真菌剂组成。随后细胞进行葡萄糖饥饿处理,即在饥饿培养基中孵育 24 小时。饥饿培养基由 89% 无葡萄糖 DMEM 和 1% 抗生素-抗真菌剂组成,并分为添加或不添加 10% FBS 两种条件。培养环境为 5% CO2、37 °C 及饱和湿度。数据来源站为 doi.org,发布机构为 Lancaster University,发布时间为 2020 年。除上述信息外,源站未提供具体的仪器设备、采样方法或实验操作细节。
【适用场景】
该数据集适用于糖酵解振荡、肿瘤细胞代谢动态、HeLa 宫颈癌细胞代谢重编程以及基于时间序列的代谢信号分析等研究方向。由于数据涉及 NADH 相关主题标签,也可用于探讨 NADH 在糖酵解振荡中的动态变化。此外,该数据集可用于比较葡萄糖饥饿条件下是否伴随 FBS 饥饿对 HeLa 细胞糖酵解振荡的影响。对于需要原始时间序列数据来验证模型、开展信号处理或进行代谢网络动力学分析的研究,该数据集具有潜在应用价值。但具体适用性仍需结合数据实际内容判断,源站未提供详细的使用案例或分析流程。
【使用方法】
数据集以 CSV 文件形式提供,包含 ’data FBS+Glc-.csv’ 和 ’data FBS-Glc-.csv’ 两个文件。使用者可根据研究目的分别读取这两个文件,对应分析 FBS 存在与缺失条件下葡萄糖饥饿 HeLa 细胞的糖酵解振荡。由于数据为时间序列,通常可借助常见的数据分析工具或编程语言进行读取、可视化与频域或时域分析。使用时应遵循 CC BY 许可要求,注明数据来源与作者信息。除文件格式与对应条件外,源站未提供具体的预处理步骤、分析代码或推荐参数。
【质量与限制】
该数据集为论文 Figure 1 的原始数据,具有明确的实验背景与来源。数据对应典型糖酵解振荡,涵盖 FBS 存在与缺失两种葡萄糖饥饿条件。然而,源站未提供样本量、重复次数、缺失值情况、噪声水平或数据预处理细节,因此无法对数据质量进行更全面的评估。此外,数据仅包含两个 CSV 文件,可能不足以覆盖所有实验条件或个体细胞差异。使用者在解释结果时应考虑这些限制,并结合原始论文获取更完整的实验背景。源站未提供其他质量相关指标或限制说明。
【引用与许可】
该数据集采用 CC BY 许可,允许在注明出处的前提下使用、分发和改编。引用时应注明数据集名称 Glycolytic oscillations in cervical cancer HeLa cells、作者 Stefanovska, Aneta 与 Rowland Adams, Joe、机构 Lancaster University、发布时间 2020 年以及来源站 doi.org。同时,相关研究论文为 Takashi Amemiya 等发表于 Chaos 的 Primordial oscillations in life direct observation of glycolytic oscillations in individual hela cervical cancer cells,该数据集为其 Figure 1 的原始数据。除上述信息外,源站未提供额外的引用格式或许可条款细节。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.17635/lancaster/researchdata/406
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集为文献[1]图1所示的原始数据。宫颈癌细胞系HeLa在生长培养基中培养后,进行葡萄糖饥饿处理,即在5% CO2、37 °C及饱和湿度条件下,于饥饿培养基中孵育24小时。生长培养基由89%高糖DMEM、10% FBS和1%抗生素-抗真菌剂组成。饥饿培养基由89%无糖DMEM和1%抗生素-抗真菌剂组成,含或不含10% FBS。文件“data FBS+Glc-.csv”和“data FBS-Glc-.csv”分别为有和没有FBS饥饿条件下,葡萄糖饥饿HeLa细胞中典型糖酵解振荡的数据。[1] Takashi Amemiya, Kenichi Shibata, Yoshihiro Itoh, Kiminori Itoh, Masatoshi Watanabe, and Tomohiko Yamaguchi. Primordial oscillations in life direct observation of glycolytic oscillations in individual hela cervical cancer cells. Chaos, 27(10):104602, 2017.描述
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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