肛门癌筛查研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT00914537

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：肛门癌。背景：人类免疫缺陷病毒（HIV）阳性男男性行为者（MSM）面临肛门癌风险，其风险程度接近发展中国家未接受筛查女性的宫颈癌风险。目前，尚无公认的方法对HIV阳性MSM进行肛门癌前病变筛查，以降低肛门癌导致的发病率和死亡率；在缺乏标准和有效的筛查手段的情况下，诊所往往求助于肛门镜检查——一种类似于阴道镜的诊断程序，并对所有HIV阳性MSM进行定向活检。目的：评估检测致癌性人乳头瘤病毒（HPV）DNA和RNA、个体致癌性HPV基因型、细胞遗传学标志物、p16(INK4a)和Ki-67免疫细胞化学染色、肛门细胞学以及这些生物标志物组合在识别HIV阳性MSM中流行性、1年累积性和2年累积性肛门癌前病变及癌症（组织学确认为大于或等于AIN3）方面的临床性能，使用基线时临床医生采集的肛门标本。资格：寻求肛门癌筛查的HIV阳性MSM。

纳入标准：1）KPNC会员；2）有记录的HIV阳性状态；3）能够且精神上有能力提供书面知情同意。排除标准：入组时当前诊断为肛门癌。设计：为满足这一需求并提高肛门癌前病变和癌症的检出率，我们提出一项筛查队列研究，纳入1，000名参与Kaiser Permanente Northern California（KPNC）健康维护计划的HIV阳性男男性行为者（MSM）。在书面知情同意下，参与的KPNC会员将回答一份自填式危险因素问卷，并在进行数字检查和高分辨率肛门镜检查之前，进行两次肛门标本采集并置于液基细胞学（LBC）培养基中。受试者将被要求在家中自行采集标本并置于相同的LBC缓冲液中，然后将标本放入准备好的回邮信封寄回，以评估自行采集在肛门癌筛查中的效用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。