nWGS_pipeline

该数据集是一个生物信息学分析流程,专门用于处理中枢神经系统样本的牛津纳米孔测序数据,包含拷贝数变异、甲基化谱、结构变异和MGMT启动子状态等多模态基因组学分析结果,主要应用于神经肿瘤的分子特征研究、表观遗传学分析和临床生物标志物发现,为脑肿瘤(如胶质瘤)的精准诊断和治疗提供数据支持。

Bope, christianBope, christian
Figshare
2025-07-15 更新
浏览 10
分类Nanopore Whole Genome Sequencingbioinformatics pipelines implemented
nWGS_pipeline

基本信息

大小
0.08 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-07-15
版本
v1

资源简介

nWGS_pipeline

【数据集背景】

源站首次发布:2025-07-15。

【数据内容】

源站原始描述:nWGS_pipeline is a comprehensive bioinformatics pipeline for analyzing Central Nervous System (CNS) samples using Oxford Nanopore sequencing data. It integrates multiple analyses, including CNV detection, methylation profiling, structural variant calling, and MGMT promoter status determination

主表 TERTp_variants.bed 含 7 列、样本前 3 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 12 个,合计 82.58 MB。TERTp_variants.bed:text/plain,192 B。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.29569931.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Central nervous system、Computational neuroscience (incl. mathematical neuroscience and theoretical neuroscience)。主题标签:Nanopore Whole Genome Sequencing、bioinformatics pipelines implemented、Oxford Nanopore Technologies DNA sequencing platforms。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Central nervous system、Computational neuroscience (incl. mathematical neuroscience and theoretical neuroscience)。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/nWGS_pipeline/29569931

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Bope, christian (2025). nWGS_pipeline. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/nWGS_pipeline/29569931/1

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数据说明

nWGS_pipeline 是一个用于分析中枢神经系统(CNS)样本的综合性生物信息学流程,专门处理牛津纳米孔测序数据。该流程整合了多种分析模块,包括拷贝数变异(CNV)检测、甲基化分析、结构变异识别以及MGMT启动子状态判定。数据来源于使用纳米孔测序技术生成的中枢神经系统样本测序数据,通过标准化的生物信息学方法进行处理和整合。主要应用于神经肿瘤学、表观遗传学和癌症基因组学研究,特别适用于脑肿瘤(如胶质瘤)的分子特征分析和临床生物标志物探索。

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