晚期实体瘤原发灶起源与治疗策略表达特征数据集

该数据集包含晚期实体瘤患者的基因表达谱,用于通过表达特征识别原发灶起源并指导治疗策略。

ChEBI
2016-02-13 更新
浏览 15
基因组transcription profiling by arrayHomo sapiens
Expression Signatures Identify Origin of Primary and Therapeutic Strategies for Patients with Advanced Solid Tumors

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2016-02-13

资源简介

晚期实体瘤原发灶起源与治疗策略表达特征数据集

【一句话概览】

本数据集是 BioStudies 公开的组学数据集,主题涵盖 transcription profiling by array、Homo sapiens,可用于生物标志物发现与分子分型研究。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Expression Signatures Identify Origin of Primary and Therapeutic Strategies for Patients with Advanced Solid Tumors》。

【数据内容】

源站原始描述:Background: Fatal cancer is often the result of spread, or metastasis, of a cancer cell from the site of its origin to a distant anatomic site. While the metastatic process and the foreign environment of the metastatic site impact a tumorâ??s biology, we continue to determine therapy for patients based upon their cancerâ??s site of origin. We have performed an unbiased analysis across metastatic solid tumors from common primary sites to determine the molecular impact of the metastatic process on…

【主题与分类】

主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-18549

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数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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