CUPiD：一种基于cfDNA甲基化的原发灶不明癌组织来源分类器 - 图表生成数据与代码

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该数据集存储了论文《A cfDNA methylation-based tissue-of-origin classifier for Cancers of Unknown Primary》（Conway、Pearce、Clipson等人合著，发表于《Nature Communications》）中用于生成所有图表的代码与数据。数据集主要包括两部分：figure_inputs（包含生成图表所需的输入数据，部分来自分类器的生成与应用过程，部分为额外的临床数据）和figure_generation（基于figure_inputs中的输入文件、用于生成论文图表的RMarkdown报告）。该数据集还提供了输出文件夹（output）和源数据文件夹（source_data），其中包含补充数据表、图表副本以及ROC曲线等大型源数据。该数据集主要用于支持原发灶不明癌（CUP）的研究，特别是基于循环游离DNA（cfDNA）甲基化特征的组织来源分类方法开发与验证，可应用于癌症起源诊断、生物标志物发现和临床转化研究。