肺类癌基因组通路表达谱数据集
包含典型肺类癌、非典型肺类癌、小细胞肺癌及正常肺组织表达谱,用于肺神经内分泌肿瘤通路分析。由Mayo Foundation for Medical Education and Research提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含64条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的类癌综合征研究。
基本信息
模态
表格
大小
0.04 GB
数据量
64
任务类型
分类
创建/更新时间
2018-05-02
资源简介
包含典型肺类癌、非典型肺类癌、小细胞肺癌及正常肺组织表达谱,用于肺神经内分泌肿瘤通路分析。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE108055
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.04 GB。
数据说明
包含典型肺类癌、非典型肺类癌、小细胞肺癌及正常肺组织表达谱,用于肺神经内分泌肿瘤通路分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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