稳定性框架第二批:肿瘤学与体细胞突变(V1.0 临床级)-37064

Stability Framework Batch 2:肿瘤与体细胞突变(V1.0 临床级)生物物理数据集,含精修坐标、口袋与毒理学分析

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文本BYCASPCCORCIDTTTbiophysical auditscancer treatmentchemotherapy targetsclinical therapeutic specificationcomputational mathematicsdrug discovery and developmentligand opportunities
Stability Framework Batch 2: Oncology & Somatic Mutation (V1.0 Clinical Grade)

基本信息

模态
文本
大小
0.000024802 GB
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

稳定性框架第二批:肿瘤学与体细胞突变(V1.0 临床级)

Stability Framework Batch 2: Oncology & Somatic Mutation (V1.0 Clinical Grade)

Stability Framework Batch 2:肿瘤与体细胞突变(V1.0 临床级)生物物理数据集,含精修坐标、口袋与毒理学分析。结构经 NRC CASP-17 优化,采用 C-alpha 引导势,经侧链松弛和口袋扩展模拟识别别构与活性腔;经 TTT-7 验证消除空间碰撞和环幻觉。CC BY 4.0 发布;PI James Paul Trageser(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):数据集标题:Stability Framework 第 2 批:肿瘤学与体细胞突变(V1.0 临床级) 概述:生物物理数据集,包含精修坐标结构、口袋分析和毒理学报告。 计算方法:使用 NRC CASP-17 Pure Math Folding Engine 优化靶标结构。该流程应用 C-alpha 谐波引导势约束($k_{guide} = 0.5$)进行比较建模(或使用 $k_{guide} = 0.0$ 进行从头建模),随后进行侧链弛豫和口袋扩张模拟,以识别变构与活性空腔。所有坐标均使用 Trageser 张量定理(TTT-7)晶格奇偶性验证进行审核,以消除立体冲突(最小原子间距离 > 1.10 Å)和环区幻觉。 许可证:依据 Creative Commons Attribution 4.0 International(CC BY 4.0)分发,以支持开放、商业和学术治疗性药物设计。 首席研究员:James Paul Trageser 所属机构:Nexus Resonance Codex ORCID:0009-0006-6678-2908 X(Twitter):@jtrag 存储库:https://GitHub.com/Nexus-Resonance-Codex/Drug-Discovery

【主题与分类】

主题标签:BY、CASP、CC、ORCID、TTT、biophysical audits、cancer treatment、chemotherapy targets、clinical therapeutic specification、computational mathematics。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.19992666

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 24.8 KB。

数据说明

数据集标题:Stability Framework 第 2 批:肿瘤学与体细胞突变(V1.0 临床级)
概述:生物物理数据集,包含精修坐标结构、口袋分析和毒理学报告。
计算方法:使用 NRC CASP-17 Pure Math Folding Engine 优化靶标结构。该流程应用 C-alpha 谐波引导势约束($k_{guide} = 0.5$)进行比较建模(或使用 $k_{guide} = 0.0$ 进行从头建模),随后进行侧链弛豫和口袋扩张模拟,以识别变构与活性空腔。所有坐标均使用 Trageser 张量定理(TTT-7)晶格奇偶性验证进行审核,以消除立体冲突(最小原子间距离 > 1.10 Å)和环区幻觉。
许可证:依据 Creative Commons Attribution 4.0 International(CC BY 4.0)分发,以支持开放、商业和学术治疗性药物设计。
首席研究员:James Paul Trageser
所属机构:Nexus Resonance Codex
ORCID:0009-0006-6678-2908
X(Twitter):@jtrag
存储库:https://GitHub.com/Nexus-Resonance-Codex/Drug-Discovery

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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