SAMVAE数据集

整合六种模态的癌症生存分析数据集,包含乳腺癌和低级别胶质瘤数据,用于多模态生存预测。

信息处理与电信中心,西班牙马德里理工大学电信工程学院信息处理与电信中心,西班牙马德里理工大学电信工程学院
arXiv
2025-07-10 更新
浏览 36
多模态癌症生存分析多模态
SAMVAE Dataset

基本信息

模态
多模态
大小
0.24 GB
创建/更新时间
2025-07-10
版本
main

资源简介

SAMVAE数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《AlbaGarridoLopezz/SAMVAE》。源站首次发布:2025-05-12。

【数据内容】

源站原始描述:## SAMVAE🪇 Survival Analysis Multimodal model based on Variational Autoencoders. This repository provides: * Necessary scripts to train SAMVAE for survival analysis and competing risks. * A guide for downloading clinical, omics, and image data from the TCGA portal. * Scripts for data preparation and preprocessing. * Validation metrics (C-index and IBS) adapted from PyCox. * A script to generate plots and interactive HTML visualizations. * A script to generate result tables as presented in the pa…

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://github.com/AlbaGarridoLopezz/SAMVAE

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-04-20,引用时请注意版本时效。

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下载信息

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暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

git clone https://github.com/AlbaGarridoLopezz/SAMVAE.git

curl -L -o repo.zip https://github.com/AlbaGarridoLopezz/SAMVAE/archive/refs/heads/main.zip
unzip repo.zip

源站 README 摘录(使用方式)

Getting Started

Follow these simple steps to make this project work on your local machine.

Prerequisites

You should have the following installed on your machine:

  • Ubuntu
  • Python 3.10.0
  • Packages in requirements.txt
    pip install -r requirements.txt
    

Installation

Download the repo manually (as a .zip file) or clone it using Git.

git clone https://github.com/AlbaGarridoLopezz/SAMVAE.git

<p align=“right”>(<a href=“#readme-top”>back to top</a>)</p>

<! USAGE EXAMPLES >

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

完整仓库:github.com/AlbaGarridoLopezz/SAMVAE

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