phs001165:eMERGE 费城儿童医院 - 全基因组测序

数据可用于肿瘤与癌症总论方向的研究,支持基于基因组变异与纵向随访信息开展疾病风险预测、关联分析等任务(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组预测Longitudinal Cohort
phs001165: eMERGE: Children's Hospital of Philadelphia - WGS

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

phs001165:eMERGE 费城儿童医院 - 全基因组测序

phs001165: eMERGE: Children's Hospital of Philadelphia - WGS 是一个来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)的 dbGaP 研究数据集,属于纵向队列(Longitudinal Cohort)类型。该数据集在本站被归类为肿瘤 / 癌症(总论)方向,其内容围绕基因组变异与纵向随访信息展开,可用于疾病风险预测、关联分析等研究任务。整体而言,该数据集面向肿瘤与癌症总论领域,提供全基因组测序(WGS)相关的数据资源,并依托纵向队列设计,为探索遗传因素与疾病发生发展之间的关系提供基础数据支持。

【数据集背景】

该数据集来自 eMERGE 项目框架下的 Children's Hospital of Philadelphia - WGS 部分,属于 dbGaP 研究,类型为纵向队列。eMERGE 通常指电子病历与基因组学网络(Electronic Medical Records and Genomics),其研究模式强调将基因组数据与电子病历信息相结合。该数据集在本站被归入肿瘤 / 癌症(总论)分类,说明其可服务于肿瘤与癌症总论方向的研究。源站描述仅标明其为 dbGaP study(Longitudinal Cohort),未提供更多关于项目发起背景、资助来源或具体研究目标的细节。

【数据内容】

该数据集的核心内容为全基因组测序(WGS)数据,并带有纵向队列属性。主题标签为 Longitudinal Cohort,表明数据涉及对同一队列的纵向随访信息。结合其肿瘤 / 癌症(总论)分类,数据可用于基于基因组变异与纵向随访信息开展疾病风险预测、关联分析等任务。源站未提供关于样本量、测序深度、覆盖范围、变异类型、随访时间跨度、随访指标等具体内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。其英文名称为 phs001165: eMERGE: Children's Hospital of Philadelphia - WGS,表明数据与 Children's Hospital of Philadelphia 相关。源站描述仅说明其为 dbGaP study(Longitudinal Cohort)。关于采集地点、采集时间、采集流程、伦理审批、知情同意方式等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

根据其分类与主题标签,该数据集可用于肿瘤与癌症总论方向的研究,支持基于基因组变异与纵向随访信息开展疾病风险预测、关联分析等任务。纵向队列设计使其适用于需要结合时间维度与遗传信息的分析场景。源站未提供关于具体适用疾病类型、分析模型、验证方法或应用案例的更多信息。

【使用方法】

源站未提供关于数据下载方式、访问权限、数据格式、分析工具、处理流程或使用步骤的具体说明。该数据集为 dbGaP 研究,通常 dbGaP 数据需通过相应申请流程获取,但源站未提供具体细节。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、完整性、准确性、偏差、局限性或使用限制的具体信息。

【引用与许可】

源站未提供关于引用方式、许可协议、使用条款或数据共享政策的具体信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001165

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Longitudinal Cohort).

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