癌症单细胞转录图谱数据集

资源简介

该数据集包含 7,930 个单细胞的转录组表达数据，涵盖三种不同生物学状态：健康免疫基线、液体肿瘤（髓样白血病）以及实体肿瘤微环境（黑色素瘤），旨在构建一个跨队列整合的单细胞分析基准，为算法性能评估与方法学对比、多队列批次效应校正（Batch Correction）、免疫耗竭状态分析、跨肿瘤类型生物标志物挖掘提供基准。 数据集构成 : Cohort A：健康免疫基线（约 2,700 个细胞） 来源：10x Genomics PBMC3k 生物学背景：健康供体外周血单个核细胞（PBMCs），作为免疫稳态对照基线 作用：用于对比肿瘤相关免疫状态变化 Cohort B：液体肿瘤 / 髓样白血病（约 2,730 个细胞） 来源：Paul et al., 2015 生物学背景：髓样祖细胞及白血病相关细胞状态的单细胞转录组数据 作用：代表血液系统恶性肿瘤模型 Cohort C：实体肿瘤微环境（约 2,500 个细胞） 来源：Tumor Immune Cell Atlas (TICAtlas) 生物学背景：来源于黑色素瘤等实体瘤微环境中的免疫细胞与恶性细胞，包括耗竭 T 细胞、巨噬细胞及肿瘤细胞 作用：用于研究实体瘤免疫抑制与细胞异质性