自体PET挑战赛

全身FDG-PET/CT中的自动病灶分割。主题标签:肿瘤、癌症、FDG-PET/CT、全身病灶分割、图像分割。本站分类:肿瘤/癌症(总论)

grand_challenge
2025-07-16 更新
浏览 9
医学影像图像分割肿瘤癌症FDG-PET/CT全身病灶分割图像分割
Grand Challenge: autoPET

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2025-07-16

资源简介

自体PET挑战赛

Grand Challenge: autoPET 是一个面向全身 FDG-PET/CT 影像的自动病灶分割数据集,主题涵盖肿瘤、癌症、FDG-PET/CT、全身病灶分割与图像分割等方向。该数据集来源于 autoPET.grand-challenge.org,源站对其核心任务的描述为“Automatic lesion segmentation in whole-body FDG-PET/CT”,即在全身氟代脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描/计算机断层扫描中实现病灶的自动分割。在本站分类体系中,该数据集归属于肿瘤 / 癌症(总论)方向,适合作为肿瘤影像分析、全身病灶识别与分割算法研究的公开数据资源。

【数据集背景】

该数据集依托 Grand Challenge 平台发布,名称为 autoPET。其设立的核心目标围绕全身 FDG-PET/CT 影像中的自动病灶分割任务展开。FDG-PET/CT 是肿瘤临床与研究中常用的全身成像方式,能够同时提供代谢信息与解剖结构信息。对全身影像中的病灶进行自动分割,有助于提升影像分析的效率与一致性,也是医学图像处理领域的重要研究方向。该数据集的主题标签包括肿瘤、癌症、FDG-PET/CT、全身病灶分割和图像分割,说明其关注点集中在肿瘤相关病灶的自动识别与分割。

【数据内容】

源站描述指出,该数据集的任务是全身 FDG-PET/CT 中的自动病灶分割。由此可知,其数据内容涉及全身 FDG-PET/CT 影像以及与之对应的病灶分割任务。关于具体的样本数量、影像模态组合方式、标注格式、文件结构、病灶类别划分等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 autoPET.grand-challenge.org,发布平台为 Grand Challenge。关于数据采集机构、采集设备型号、采集时间范围、受试者来源与纳入排除标准等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与任务描述,该数据集适用于肿瘤与癌症相关的全身病灶分割研究,尤其是面向 FDG-PET/CT 的自动分割算法开发与评估。其“全身”与“病灶分割”的属性,使其可用于探索多病灶、全身范围内的自动识别与分割方法。关于具体的竞赛任务设置、评价指标、排行榜规则或临床应用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 Grand Challenge 平台发布,通常此类平台以在线挑战的形式提供数据访问与结果评测。关于数据下载方式、使用协议、提交格式、评测流程与基线方法等具体操作信息,源站未提供。

【质量与限制】

关于该数据集的标注质量、数据规模、类别平衡性、影像质量差异、潜在偏倚以及使用限制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款与版权归属等信息,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://autopet.grand-challenge.org/

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Automatic lesion segmentation in whole-body FDG-PET/CT

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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