CCLE细胞系注释数据集

从CCLE数据库下载的癌细胞系注释表格数据。

Xiaoxi YangXiaoxi Yang
Figshare
2020-03-23 更新
浏览 13
表格分类pan-cancer cell lines informationbioinformatic analysespan-cancer cell lines omics dataCancerCancer Cell BiologyBioinformatics
Cell_lines_annotations_20181226.txt

基本信息

模态
表格
大小
1.203293252 GB
任务类型
分类
许可
CC0
创建/更新时间
2020-03-23
版本
v2

资源简介

CCLE细胞系注释数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Cancer cell lines raw data》。源站首次发布:2020-03-23。

【数据内容】

源站原始描述:Cancer cell lines annotation and omics data downloaded from CCLE database

主表 Cell_lines_annotations_20181226.txt 含 33 列、样本前 1462 行结构完整。

文件 RPPA.txt 为文本内容,开头为:DMS53_LUNG SW1116_LARGE_INTESTINE NCIH1694_LUNG P3HR1_HAEMATOPOIETIC_AND_LYMPHOID_TISSUE HUT78_HAEMATOPOIETIC_AND_LYMPHOID_TISSUE UMUC3_URINARY_TRACT HOS_BONE …

【数据结构与技术规格】

文件数 6 个,合计 1.20 GB。Cell_lines_annotations_20181226.txt:text/plain,335.36 KB。RPPA.txt:text/plain,1.83 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.12016968.v2。

【主题与分类】

源站学科分类:Oncology and carcinogenesis not elsewhere classified、Cancer cell biology、Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。主题标签:pan-cancer cell lines information、bioinformatic analyses、pan-cancer cell lines omics data、Cancer、Cancer Cell Biology、Bioinformatics。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Cell_lines_annotations_20181226_txt/12016968

使用许可:CC0(https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/)。

规范引用:Yang, Xiaoxi (2020). Cancer cell lines raw data. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Cell_lines_annotations_20181226.txt" "https://ndownloader.figshare.com/files/22079508"
curl -L -o "miRNA.txt" "https://ndownloader.figshare.com/files/22080120"
curl -L -o "RPPA.txt" "https://ndownloader.figshare.com/files/22080123"
curl -L -o "CNV_segmetation.txt" "https://ndownloader.figshare.com/files/22080126"
curl -L -o "mRNA.txt" "https://ndownloader.figshare.com/files/22080132"
curl -L -o "METHY.txt" "https://ndownloader.figshare.com/files/22080141"

文件清单

  • Cell_lines_annotations_20181226.txt(335.36 KB)
  • miRNA.txt(8.14 MB)
  • RPPA.txt(1.83 MB)
  • CNV_segmetation.txt(46.71 MB)
  • mRNA.txt(767.07 MB)
  • METHY.txt(379.22 MB)

文件总体积 1.20 GB(源站 API 实测)。

数据说明

Cancer cell lines annotation and omics data downloaded from CCLE database.

许可

CC0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.12016968.v2(source: https://figshare.com/articles/dataset/Cell_lines_annotations_20181226_txt/12016968)。

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