K-4CARE分析验证：一种综合性基因组图谱检测
K-4CARE肿瘤综合基因组图谱检测的分析验证，整合ctDNA追踪用于残余癌症监测，对应NCBI SRA SRP470036测序数据。
基本信息
资源简介
K-4CARE分析验证：一种综合性基因组图谱检测
【一句话概览】
本研究对肿瘤综合基因组分析（CGP）检测K-4CARE进行了深入的分析验证。该检测整合个性化循环肿瘤DNA（ctDNA）追踪，用于残存肿瘤监测。近年来CGP逐步获得临床认可，助力精准肿瘤学；单次检测即可全面呈现肿瘤的基因与基因组变异，帮助医生进行疾病诊断、预后判断和治疗选择。相关项目编号为PRJNA1035299，标签为Gene Solutions（来源 NCBI）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Analytical validation of K-4CARE: a comprehensive genomic profiling》。源站首次发布：2023-11-07。
【数据内容】
源站原始描述：Comprehensive genomic profiling (CGP) has gradually gained acceptance in clinical practice to empower precision oncology in recent years. A single assay could provides a broad picture of genetic and genomic alterations in the tumor, which then aids physicians in disease diagnosis, prognosis and treatment selection. This study demonstrated an in-depth analytical validation of K-4CARE, a tumor CGP assay that integrates personalized circulating tumor DNA (ctDNA) tracking for residual cancer surveil…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：近年来，全面基因组分析（CGP）逐渐在临床实践中获得认可，以助力精准肿瘤学。单次检测即可提供肿瘤遗传与基因组改变的全局视图，从而帮助医生进行疾病诊断、预后判断和治疗选择。本研究对K-4CARE进行了深入的分析验证；K-4CARE是一种肿瘤CGP检测，整合了个性化循环肿瘤DNA（ctDNA）追踪，用于残留癌症监测。
【主题与分类】
主题标签：PRJNA1035299、Gene Solutions。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP470036
下载信息
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数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP470036
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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