RNA聚合酶II CTD在体内对转录非必需但终止所需
该数据集来自NCBI GEO（GSE210601），包含1个文件（GSE210601_series_matrix.txt.gz），主题为高通量测序的基因组结合/占据谱分析，物种为人类（9606），平台GPL11154，分类归入肿瘤/伯基特淋巴瘤
基本信息
资源简介
RNA聚合酶II CTD在体内对转录非必需但终止所需
RNA Polymerase II CTD is dispensable for transcription in vivo and required for termination
该数据集来自NCBI GEO（GSE210601），包含1个文件（GSE210601_series_matrix.txt.gz），主题为高通量测序的基因组结合/占据谱分析，物种为人类（9606），平台GPL11154，分类归入肿瘤/伯基特淋巴瘤。源站描述显示研究分析了携带大片段CTD截断的CTD-∆5突变体的转录表型，发现该突变体可在活细胞中广泛转录基因，但呈现极端弥漫表型且终止严重受损，并丧失与Mediator和Integrator复合体的相互作用；长距离相互作用和CTCF结合模式未见TAD结构域或边界的重大改变。数据可用于研究RNA聚合酶II CTD在转录终止中的作用（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Aug 05 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：RNA聚合酶（Pol）II的最大亚基含有一个进化上保守的C端结构域（CTD），由七肽重复序列组成，在转录过程中处于核心地位。在此，我们分析了携带大片段CTD截断的CTD-∆5突变体的转录表型。出乎意料的是，我们的结果表明该突变体可在活细胞中广泛转录基因，但表现出极端弥漫的表型，终止严重受损，与先前表征的CTD酪氨酸残基突变相似但受损更严重。CTD-∆5突变体还丧失了与参与转录激活和RNA成熟的Mediator和Integrator复合体的相互作用。对CTD-∆5中长距离相互作用和CTCF结合模式的检查未显示TAD结构域或边界的重大变化。我们的数据表明C
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL11154、9606。本站分类：肿瘤/伯基特淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE210601
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 20 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
RNA聚合酶（Pol）II的最大亚基含有一个进化上保守的C端结构域（CTD），由七肽重复序列组成，在转录过程中发挥核心作用。本文中，我们分析了携带大规模CTD截短的CTD-∆5突变体的转录表型。出乎意料的是，我们的结果表明，该突变体能够在活细胞中广泛转录基因，但表现出极端的广泛分布表型，终止严重受损，与先前鉴定的CTD酪氨酸残基突变体相似但损伤更为严重。CTD-∆5突变体还丧失了与参与转录激活和RNA成熟的Mediator和Integrator复合物的相互作用。对CTD-∆5中长距离相互作用和CTCF结合模式的检查未显示TAD结构域或边界的重大变化。我们的数据表明，CTD在活细胞中对转录行为本身在很大程度上是非必需的。我们提出一个模型，其中CTD缺失的Pol II进入DNA的速率较低，但一旦参与转录便变得极其广泛分布，导致终止的全局性丧失。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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