德国癌症研究中心生物信息学与系统生物学数据集

该数据集来源于 omicsdi.org,属于肿瘤 / 伯基特淋巴瘤分类,主题标签为 Genomics。可用于伯基特淋巴瘤相关的 miRNA 表达分析、分子分型及基因组学研究,为肿瘤标志物筛选与机制探索提供数据基础(来源 omicsdi.org)

omicsdi
浏览 12
基因组分类Genomics
ena-DATASET-DKFZ-IBIOS-23-09-2015-12:28:32:695-418 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

德国癌症研究中心生物信息学与系统生物学数据集

该数据集英文名称为 ena-DATASET-DKFZ-IBIOS-23-09-2015-12:28:32:695-418 - samples,来源于 omicsdi.org,在分类上归属于肿瘤 / 伯基特淋巴瘤,主题标签为 Genomics。从源站描述来看,这是一批 miRNA 测序数据,取自数据集 EGAD00001000650(MMML)中的 43 个病例。作为一项以基因组学为核心标签的数据资源,它围绕伯基特淋巴瘤这一特定肿瘤类型,提供了 miRNA 层面的测序信息,可用于 miRNA 表达分析、分子分型以及相关基因组学研究,为肿瘤标志物筛选和机制探索提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集所属分类为肿瘤 / 伯基特淋巴瘤。伯基特淋巴瘤是一种与基因组异常密切相关的肿瘤类型,围绕其开展分子层面的研究,有助于理解肿瘤发生发展中的基因表达调控变化。该数据集以 Genomics 为主题标签,说明其定位在基因组学研究的范畴内。源站描述指出,这批数据是来自数据集 EGAD00001000650(MMML)中 43 个病例的 miRNA 测序数据,表明其建立在一个规模为 43 例的样本集合之上,并聚焦于 miRNA 这一特定分子层面。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 miRNA 测序数据,覆盖 43 个病例。这些病例来自数据集 EGAD00001000650(MMML)。miRNA 是一类在基因表达调控中发挥重要作用的小分子 RNA,针对其开展测序,可以获取样本中 miRNA 的表达信息。数据集名称中包含“samples”字样,提示其内容与样本层面的数据相关。除上述信息外,关于数据的具体文件格式、数据量、测序平台、读长、表达矩阵结构等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述明确说明,这批 miRNA 测序数据取自数据集 EGAD00001000650(MMML)中的 43 个病例。数据集英文名称中包含 DKFZ-IBIOS 以及时间戳信息,但关于样本采集的具体地点、时间、临床背景、伦理审批信息以及原始测序实验的具体流程,源站未提供。

【适用场景】

依据其分类与主题标签,该数据集可用于伯基特淋巴瘤相关的 miRNA 表达分析、分子分型及基因组学研究,并可为肿瘤标志物筛选与机制探索提供数据基础。具体而言,研究者可围绕 43 个病例的 miRNA 测序数据,开展表达差异分析、样本间比较以及与其他基因组学数据的整合研究。由于该数据集归属于肿瘤 / 伯基特淋巴瘤分类,其适用场景集中在与伯基特淋巴瘤相关的分子机制和标志物研究方向上。除上述方向外,其他具体应用场景源站未提供。

【使用方法】

关于该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、访问地址、所需分析工具、预处理流程、标准化方法以及配套元数据的使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 43 个病例的 miRNA 测序数据构建,样本规模有限。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、缺失情况、批次效应以及可能存在的偏倚,源站未提供。使用者在将其用于伯基特淋巴瘤相关研究时,应结合自身研究目的对数据适用性进行判断。除源站描述所提及的内容外,其他质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发等信息,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001619

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

miRNA seq data of 43 cases out of dataset EGAD00001000650 (MMML)

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案