EGAS00001001021-sc-20150422 - 样本

源站描述表明其内容是对一例致死性 EBV 驱动的 LPD 进行外显子测序。数据覆盖该病例的外显子测序样本,可用于研究 EBV 相关淋巴增殖性疾病的基因组变异特征,并支持肿瘤分类等相关分析(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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基因组分类Genomics
EGAS00001001021-sc-20150422 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

EGAS00001001021-sc-20150422 - 样本

EGAS00001001021-sc-20150422 - samples 是一个与肿瘤研究相关的数据集,分类上归属于伯基特淋巴瘤方向,来源站为 omicsdi.org。该数据集围绕一例致死性 EBV 驱动的淋巴增殖性疾病(LPD)展开外显子测序,主题标签为 Genomics。从整体定位看,它为研究者提供了针对该特定病例的外显子测序样本信息,可用于观察 EBV 相关淋巴增殖性疾病在基因组层面的变异特征,并支持肿瘤分类等相关分析。该数据集的核心价值在于将罕见或致死性 EBV 驱动 LPD 病例与外显子测序数据关联起来,为后续的基因组学探索、疾病机制研究和分类分析提供样本层面的基础。

【数据集背景】

该数据集对应的疾病背景是 EBV 驱动的淋巴增殖性疾病(LPD),并且源站描述特别指出这是一例致死性病例。EBV 即 Epstein-Barr 病毒,与多种淋巴增殖性疾病的发生发展相关。伯基特淋巴瘤作为本站分类归属,提示该数据集在肿瘤分类体系中与伯基特淋巴瘤方向存在关联。数据集英文名中包含 sc-20150422 等标识,表明其可能对应特定样本集合或项目批次。整体而言,该数据集处于肿瘤基因组学与 EBV 相关 LPD 研究的交叉领域,主题标签 Genomics 进一步说明其关注点在于基因组层面的信息。

【数据内容】

该数据集的内容是对一例致死性 EBV 驱动的 LPD 进行外显子测序。外显子测序通常针对基因组中的蛋白编码区域,用于发现与疾病相关的变异。数据覆盖该病例的外显子测序样本,意味着样本层面的信息可供进一步分析。源站描述仅说明“Exome sequencing of a case of lethal EBV-driven LPD”,未提供样本数量、测序深度、覆盖度、变异位点数量等具体指标。因此,关于数据内容的具体规模和技术参数,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述表明其内容是对一例致死性 EBV 驱动的 LPD 进行外显子测序。数据集的英文名称中包含 EGAS00001001021-sc-20150422 - samples,可能对应欧洲基因组档案库(EGA)相关的登录标识以及样本集合标识。关于样本采集地点、采集时间、患者人口学信息、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

根据源站描述和主题标签,该数据集可用于研究 EBV 相关淋巴增殖性疾病的基因组变异特征,并支持肿瘤分类等相关分析。具体而言,外显子测序数据可用于探索该病例中可能与疾病发生、发展相关的编码区变异。由于该病例为致死性 EBV 驱动 LPD,数据也可能适用于罕见或重症 LPD 的基因组学比较研究。本站分类为肿瘤 / 伯基特淋巴瘤,提示其可在伯基特淋巴瘤及相关淋巴增殖性疾病的分类分析中作为参考。关于其他具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以样本形式提供,名称中包含“samples”,表明其可能以样本集合的方式组织。使用者可根据外显子测序数据的常规分析流程进行处理,例如比对、变异检测、注释和过滤等。由于源站未提供具体的文件格式、数据访问方式、下载链接或分析指南,关于如何获取和使用该数据集的具体步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅涉及一例致死性 EBV 驱动的 LPD 病例,样本量可能有限,因此基于该数据集得出的结论在推广到更广泛人群或其他 LPD 亚型时需要谨慎。源站描述未提供测序质量指标、覆盖度、重复性、验证情况等信息。关于数据质量的具体评估以及使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 omicsdi.org,英文名称中包含 EGAS00001001021 等标识。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发等,源站未提供。使用者应参考来源站 omicsdi.org 上对应记录的相关说明。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001347

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Exome sequencing of a case of lethal EBV-driven LPD

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