基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-12

资源简介

EBV转化B细胞全基因组测序样本集

EGAS00001000955-sc-20150805 - samples 是一个围绕EBV转化B细胞开展全基因组测序的样本数据集，来源站为omicsdi.org，在分类上归属于肿瘤领域中的伯基特淋巴瘤方向，主题标签为Genomics。该数据集的核心目标在于，通过全基因组测序手段，探究EBV诱导活化诱导胞苷脱氨酶（AID）之后，是否会在基因组范围内产生突变和/或染色体易位。围绕这一目标，数据集提供了EBV转化B细胞的全基因组测序样本集合，可用于从基因组层面观察与EBV转化及AID诱导相关的变异特征。整体而言，该数据集属于肿瘤基因组学与病毒相关B细胞转化研究交叉方向上的测序样本资源，其价值主要体现在为理解EBV、AID与基因组变异之间的关系提供样本层面的数据基础。

【数据集背景】

该数据集所关注的生物学背景，是EBV转化B细胞过程中可能发生的基因组层面改变。源站描述明确指出，开展全基因组测序的目的，是确定EBV诱导活化诱导胞苷脱氨酶（AID）是否产生全基因组突变和/或染色体易位。AID通常与抗体多样性相关，而在EBV转化B细胞的语境下，其诱导是否会导致更广泛的基因组突变或染色体结构异常，是该数据集试图回答的问题。数据集被归类于肿瘤/伯基特淋巴瘤方向，说明其研究背景与B细胞肿瘤、尤其是伯基特淋巴瘤相关的B细胞转化和基因组不稳定性问题存在关联。主题标签为Genomics，进一步表明该数据集属于基因组学范畴，主要面向全基因组水平的序列信息分析。

【数据内容】

该数据集为EBV转化B细胞的全基因组测序样本集。其内容围绕全基因组测序样本展开，样本类型为EBV转化的B细胞。源站描述强调，测序的目的是判断EBV诱导AID是否产生全基因组突变和/或染色体易位，因此数据集所包含的样本可用于支持对全基因组范围内突变和染色体易位事件的检测与分析。除上述信息外，关于样本数量、测序深度、覆盖度、具体突变位点、染色体易位断点、数据文件格式及数据量等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。数据集英文名称为EGAS00001000955-sc-20150805 - samples，其中包含样本集相关标识。其分类为肿瘤/伯基特淋巴瘤，主题标签为Genomics。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、供体信息、细胞培养条件、EBV转化方法、测序平台、建库方式及原始数据产生流程等，源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述，该数据集适用于围绕EBV转化B细胞的全基因组测序分析，尤其是用于探究EBV诱导AID是否导致全基因组突变和/或染色体易位的研究场景。其分类为肿瘤/伯基特淋巴瘤，因此也可用于与伯基特淋巴瘤相关的B细胞基因组变异研究背景。主题标签Genomics表明其适用于基因组学分析。关于是否适用于其他特定疾病、特定实验设计或临床诊断场景，源站未提供。

【使用方法】

该数据集为全基因组测序样本集，理论上可用于全基因组测序数据的进一步分析，例如突变检测和染色体易位分析，以回答EBV诱导AID是否产生全基因组突变和/或染色体易位这一问题。但关于具体的数据下载方式、文件组织方式、分析流程、推荐软件、参考基因组版本、质控步骤及重现分析方法等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的目标明确，即通过全基因组测序判断EBV诱导AID是否产生全基因组突变和/或染色体易位。其分类为肿瘤/伯基特淋巴瘤，主题标签为Genomics。然而，关于样本质量、测序质量、覆盖均匀性、数据完整性、批次效应、潜在污染、样本量是否足以支持统计推断，以及结果是否具有普遍性等质量与限制信息，源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处、DOI、数据使用许可、访问权限、是否开放获取及使用限制等信息，源站未提供。

原始链接

https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001458

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001458

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Whole genome sequencing of EBV-transformed B cells in order to determine whether EBV induction of activation-induced cytidine deaminase (AID) produces genome-wide mutations and/or chromosomal rearrangements.

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别