人乳腺癌队列转录谱分析揭示体液免疫系统对淋巴结阴性乳腺癌具有关键预后影响
该数据集来自 ebi.ac.uk,为肿瘤/乳腺癌分类下的人乳腺癌队列转录谱分析数据,主题标签为 transcription profiling by array 与 Homo sapiens

基本信息
资源简介
人乳腺癌队列转录谱分析揭示体液免疫系统对淋巴结阴性乳腺癌具有关键预后影响
Transcription profiling of human breast cancer cohort reveals the humoral immune system has a key prognostic impact in node-negative breast cancer
该数据集来自 ebi.ac.uk,为肿瘤/乳腺癌分类下的人乳腺癌队列转录谱分析数据,主题标签为 transcription profiling by array 与 Homo sapiens。源站描述显示,研究分析了 200 例术后未接受全身治疗患者的肿瘤基因表达模式,通过层次聚类识别与增殖、类固醇激素受体表达及 B 细胞和 T 细胞浸润相关的共调控基因,并以 metagene 作为替代指标结合主成分分析可视化其与转移时间的相对表达关系。数据可用于探索乳腺癌预后相关基因表达模式及免疫系统在淋巴结阴性乳腺癌中的预后作用(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):雌激素受体(ER)表达和增殖活性是乳腺癌公认的预后因素。为寻找其他预后线索,我们采用发现性方法分析了 200 例术后未接受全身治疗患者的肿瘤基因表达模式。进行层次聚类分析后,我们识别出与增殖、类固醇激素受体表达以及 B 细胞和 T 细胞浸润等生物学过程相关的共调控基因。我们计算了 metagene 作为特定聚类内所有基因的替代指标,并通过主成分分析可视化其与转移时间的相对表达关系。不同的模式引出了免疫系统在增殖相关基因高表达肿瘤中具有预后作用的假设。在多变量 Cox 回归中,a
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-ECPF-GEOD-11121
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数据说明
S-ECPF-GEOD-11121 人类乳腺癌队列的转录谱分析揭示体液免疫系统在淋巴结阴性乳腺癌中具有关键的预后影响。雌激素受体(ER)表达和增殖活性是乳腺癌公认的预后因素。在一项搜索中
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




