褪黑素对三阴性乳腺癌细胞miRNAs调控的作用
该数据集来自 figshare,配套论文发表于 PLOS ONE(2020 年),聚焦褪黑素对三阴性乳腺癌细胞中 miRNA 表达的调控作用

基本信息
资源简介
褪黑素对三阴性乳腺癌细胞miRNAs调控的作用
The role of melatonin on miRNAs modulation in triple-negative breast cancer cells
该数据集来自 figshare,配套论文发表于 PLOS ONE(2020 年),聚焦褪黑素对三阴性乳腺癌细胞中 miRNA 表达的调控作用。源站描述显示,研究通过 Taqman 检测分析褪黑素处理后 miRNA 表达变化,鉴定出 17 个差异表达 miRNA(6 个下调、11 个上调),并重点关注抗转移的 miR-148b 与致癌的 miR-210。数据集含 8 个文件(docx、pdf、xlsx 格式),可用于研究褪黑素抗肿瘤与抗转移机制及 miRNA 调控网络(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《The role of melatonin on miRNAs modulation in triple-negative breast cancer cells》发表于 PLOS ONE(2020),DOI:10.1371/journal.pone.0228062。源站首次发布:2020-02-03。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):褪黑素是由松果体分泌的激素,通过减少肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭发挥抗转移作用。MicroRNA(miRNA)是小型非编码 RNA,在基因表达调控和细胞生物过程中起关键作用。在此,我们寻找褪黑素的肿瘤/转移抑制 actions 与三阴性乳腺癌细胞中 miRNA 表达之间的联系。我们证明褪黑素通过减少三阴性乳腺癌细胞的增殖、迁移和 c-Myc 表达发挥抗肿瘤作用。通过使用基于 Taqman 的检测,我们分析了褪黑素处理三阴性乳腺癌细胞后一组 miRNA 的表达水平,并鉴定出 17 个差异表达 miRNA,其中 6 个下调、11 个上调。我们重点关注抗转移的 miR-148b 和致癌的 mi
【数据结构与技术规格】
文件数 8 个,合计 10.18 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0228062。
【主题与分类】
源站学科分类:Biophysics、Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified。主题标签:miR -210 expression、melatonin treatment、tumor cell proliferation、RNA、breast cancer cells、metastatic trait inhibition、oncogenic miR -210、miRNA、triple-negative breast cancer cells、miR -148b sponge。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_role_of_melatonin_on_miRNAs_modulation_in_triple-negative_breast_cancer_cells/11794755
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Ferreira, Lívia C.; Orso, Francesca; Dettori, Daniela; Lacerda, Jéssica Z.; Borin, Thaiz F.; Taverna, Daniela; et al. (2020). The role of melatonin on miRNAs modulation in triple-negative breast cancer cells. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-04,引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取(Figshare)
- 源站标题:The role of melatonin on miRNAs modulation in triple-negative breast cancer cells
- DOI:10.1371/journal.pone.0228062
- 发布日期:2020-02-03
- 文件数:8 个
- 文件总体积:10.18 MB
- 源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_role_of_melatonin_on_miRNAs_modulation_in_triple-negative_breast_cancer_cells/11794755
命令行下载
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文件清单
pone.0228062.s001.docx(868.10 KB)pone.0228062.s002.docx(5.75 MB)pone.0228062.s003.pdf(424.41 KB)pone.0228062.s004.pdf(406.63 KB)pone.0228062.s005.pdf(444.70 KB)pone.0228062.s006.xlsx(17.59 KB)pone.0228062.s007.pdf(1.05 MB)pone.0228062.s008.pdf(1.23 MB)
文件总体积 10.18 MB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
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img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
褪黑素是由松果体分泌的一种激素,通过减少肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭发挥抗转移作用。微小RNA(miRNA)是一类小型非编码RNA,在基因表达调控和细胞生物学过程中发挥关键作用。本研究旨在探寻褪黑素的肿瘤/转移抑制作用与三阴性乳腺癌细胞中miRNA表达之间的关联。我们证实,褪黑素通过减少三阴性乳腺癌细胞的增殖、迁移及c-Myc表达发挥抗肿瘤作用。利用基于Taqman的检测方法,我们分析了褪黑素处理三阴性乳腺癌细胞后一组miRNA的表达水平,鉴定出17个差异表达的miRNA,其中6个下调、11个上调。我们重点关注了褪黑素处理后均上调的抗转移miR-148b和致癌性miR-210,并研究了二者调控对褪黑素介导的肿瘤进展抑制效应的影响。
令人惊讶的是,当使用特异性miR-148b海绵或anti-miR-210在三阴性乳腺癌细胞中敲低miR-148b或miR-210时,褪黑素对迁移抑制和c-myc下调的作用仍然可见,这表明褪黑素处理后观察到的miR-148b和miR-210表达增加并非褪黑素发挥功效所必需。尽管如此,我们的结果表明,褪黑素是一种抑制转移性状的化合物,尤其是在MDA-MB-231乳腺癌细胞中,尽管某些蛋白质或miRNA表达调控与褪黑素效应之间的直接联系仍有待确立。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0228062(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_role_of_melatonin_on_miRNAs_modulation_in_triple-negative_breast_cancer_cells/11794755)。
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