褪黑素对三阴性乳腺癌细胞miRNAs调控的作用

该数据集来自 figshare,配套论文发表于 PLOS ONE(2020 年),聚焦褪黑素对三阴性乳腺癌细胞中 miRNA 表达的调控作用

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2023-06-04 更新
浏览 3
基因组分类miR -210 expressionmelatonin treatmenttumor cell proliferationRNAbreast cancer cellsmetastatic trait inhibitiononcogenic miR -210miRNAtriple-negative breast cancer cellsmiR -148b spongemiR -148bMDA-MB -231 breast cancer cells
The role of melatonin on miRNAs modulation in triple-negative breast cancer cells

基本信息

模态
基因组
大小
0.01018495 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-04
版本
v1

资源简介

褪黑素对三阴性乳腺癌细胞miRNAs调控的作用

The role of melatonin on miRNAs modulation in triple-negative breast cancer cells

该数据集来自 figshare,配套论文发表于 PLOS ONE(2020 年),聚焦褪黑素对三阴性乳腺癌细胞中 miRNA 表达的调控作用。源站描述显示,研究通过 Taqman 检测分析褪黑素处理后 miRNA 表达变化,鉴定出 17 个差异表达 miRNA(6 个下调、11 个上调),并重点关注抗转移的 miR-148b 与致癌的 miR-210。数据集含 8 个文件(docx、pdf、xlsx 格式),可用于研究褪黑素抗肿瘤与抗转移机制及 miRNA 调控网络(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《The role of melatonin on miRNAs modulation in triple-negative breast cancer cells》发表于 PLOS ONE(2020),DOI:10.1371/journal.pone.0228062。源站首次发布:2020-02-03。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):褪黑素是由松果体分泌的激素,通过减少肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭发挥抗转移作用。MicroRNA(miRNA)是小型非编码 RNA,在基因表达调控和细胞生物过程中起关键作用。在此,我们寻找褪黑素的肿瘤/转移抑制 actions 与三阴性乳腺癌细胞中 miRNA 表达之间的联系。我们证明褪黑素通过减少三阴性乳腺癌细胞的增殖、迁移和 c-Myc 表达发挥抗肿瘤作用。通过使用基于 Taqman 的检测,我们分析了褪黑素处理三阴性乳腺癌细胞后一组 miRNA 的表达水平,并鉴定出 17 个差异表达 miRNA,其中 6 个下调、11 个上调。我们重点关注抗转移的 miR-148b 和致癌的 mi

【数据结构与技术规格】

文件数 8 个,合计 10.18 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0228062。

【主题与分类】

源站学科分类:Biophysics、Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified。主题标签:miR -210 expression、melatonin treatment、tumor cell proliferation、RNA、breast cancer cells、metastatic trait inhibition、oncogenic miR -210、miRNA、triple-negative breast cancer cells、miR -148b sponge。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_role_of_melatonin_on_miRNAs_modulation_in_triple-negative_breast_cancer_cells/11794755

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Ferreira, Lívia C.; Orso, Francesca; Dettori, Daniela; Lacerda, Jéssica Z.; Borin, Thaiz F.; Taverna, Daniela; et al. (2020). The role of melatonin on miRNAs modulation in triple-negative breast cancer cells. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-04,引用时请注意版本时效。

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文件清单

  • pone.0228062.s001.docx(868.10 KB)
  • pone.0228062.s002.docx(5.75 MB)
  • pone.0228062.s003.pdf(424.41 KB)
  • pone.0228062.s004.pdf(406.63 KB)
  • pone.0228062.s005.pdf(444.70 KB)
  • pone.0228062.s006.xlsx(17.59 KB)
  • pone.0228062.s007.pdf(1.05 MB)
  • pone.0228062.s008.pdf(1.23 MB)

文件总体积 10.18 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

褪黑素是由松果体分泌的一种激素,通过减少肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭发挥抗转移作用。微小RNA(miRNA)是一类小型非编码RNA,在基因表达调控和细胞生物学过程中发挥关键作用。本研究旨在探寻褪黑素的肿瘤/转移抑制作用与三阴性乳腺癌细胞中miRNA表达之间的关联。我们证实,褪黑素通过减少三阴性乳腺癌细胞的增殖、迁移及c-Myc表达发挥抗肿瘤作用。利用基于Taqman的检测方法,我们分析了褪黑素处理三阴性乳腺癌细胞后一组miRNA的表达水平,鉴定出17个差异表达的miRNA,其中6个下调、11个上调。我们重点关注了褪黑素处理后均上调的抗转移miR-148b和致癌性miR-210,并研究了二者调控对褪黑素介导的肿瘤进展抑制效应的影响。

令人惊讶的是,当使用特异性miR-148b海绵或anti-miR-210在三阴性乳腺癌细胞中敲低miR-148b或miR-210时,褪黑素对迁移抑制和c-myc下调的作用仍然可见,这表明褪黑素处理后观察到的miR-148b和miR-210表达增加并非褪黑素发挥功效所必需。尽管如此,我们的结果表明,褪黑素是一种抑制转移性状的化合物,尤其是在MDA-MB-231乳腺癌细胞中,尽管某些蛋白质或miRNA表达调控与褪黑素效应之间的直接联系仍有待确立。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0228062(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/The_role_of_melatonin_on_miRNAs_modulation_in_triple-negative_breast_cancer_cells/11794755)。

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