Arylamine N-Acetyltransferase 1 敲除乳腺癌细胞的蛋白质组分析
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/乳腺癌分类，主题为 Arylamine N-Acetyltransferase 1（NAT1）敲除对乳腺癌细胞蛋白质组的影响
基本信息
资源简介
Arylamine N-Acetyltransferase 1 敲除乳腺癌细胞的蛋白质组分析
该数据集名为 Proteomic Analysis of Arylamine N-Acetyltransferase 1 Knockout Breast Cancer Cells，来源于 omicsdi.org，在本站归入肿瘤 / 乳腺癌分类。其主题聚焦于 Arylamine N-Acetyltransferase 1（NAT1）敲除对乳腺癌细胞蛋白质组的影响。NAT1 是一种 II 相代谢酶，在乳腺癌中常出现上调。该数据集通过蛋白质组学手段，比较了亲本 MDA-MB-231 乳腺癌细胞与两个独立的 NAT1 敲除细胞系之间的蛋白质组差异，旨在从整体蛋白层面观察 NAT1 缺失所带来的变化。数据集涉及的主题标签包括 Breast cancer、Nat1、Mda 和 Tmt10plex，提示其采用 TMT10plex 标记策略开展定量蛋白质组分析。
【数据集背景】
NAT1 是一种 II 相代谢酶，在乳腺癌中频繁上调。既往研究显示，在乳腺癌细胞系中抑制或耗竭 NAT1 会导致体外和体内生长迟缓，这提示 NAT1 可能促进乳腺癌细胞的快速生长。基于这一背景，本项目旨在评估 NAT1 敲低对一种乳腺癌细胞系蛋白质组的影响。该研究关注的是 NAT1 缺失后细胞整体蛋白质表达谱的变化，从而为理解 NAT1 在乳腺癌细胞生长中的作用提供蛋白质组层面的证据。
【数据内容】
该数据集包含的生物学分组为：一个亲本 MDA-MB-231 乳腺癌细胞系，以及两个独立的 NAT1 敲除（KO）细胞系，这两个敲除细胞系在增殖速率上存在差异。数据集的核心内容是针对上述细胞系开展的蛋白质组分析，采用 TMT10plex 标记技术进行定量比较。主题标签中的 Breast cancer、Nat1、Mda 和 Tmt10plex 概括了该数据集的疾病背景、目标分子、细胞模型和主要技术手段。源站描述未提供具体的蛋白鉴定数量、差异表达蛋白列表、定量数值或统计结果。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，本站将其归类为肿瘤 / 乳腺癌。源站描述说明了实验设计的基本框架：以亲本 MDA-MB-231 细胞为对照，与两个独立的 NAT1 敲除细胞系进行比较，这两个敲除细胞系具有不同的增殖速率。关于样本制备、质谱平台、色谱条件、数据采集参数等具体实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究 NAT1 在乳腺癌细胞中的功能，尤其是从蛋白质组层面探索 NAT1 敲除或缺失对细胞整体蛋白表达的影响。由于包含两个增殖速率不同的 NAT1 敲除细胞系，该数据集也可用于比较不同增殖状态下蛋白质组变化的异同。此外，采用 TMT10plex 标记的定量蛋白质组数据可用于差异蛋白筛选、通路富集分析等常见下游分析。该数据集面向肿瘤生物学、乳腺癌代谢与蛋白质组学等研究方向。
【使用方法】
该数据集可通过 omicsdi.org 获取。使用者可根据源站提供的分组信息，将亲本 MDA-MB-231 细胞与两个 NAT1 敲除细胞系进行对比分析。由于采用 TMT10plex 标记，分析时需考虑标记通道与样本的对应关系以及批次效应。具体的下载方式、文件格式、数据处理流程和推荐分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于亲本 MDA-MB-231 细胞和两个独立的 NAT1 敲除细胞系，分组设计具有独立性。两个敲除细胞系增殖速率不同，可能为结果解释带来额外的生物学变量。关于样本量、重复次数、质谱数据质量、缺失值比例、定量准确性等质量指标，源站未提供。此外，该数据集仅涉及一种乳腺癌细胞系，结论外推到其他细胞系或临床样本时需谨慎。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD035953
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
NAT1是一种II相代谢酶，在乳腺癌中经常上调。先前的研究表明，在乳腺癌细胞系中抑制或耗竭NAT1会导致体外和体内生长迟缓，提示NAT1促进乳腺癌细胞的快速生长。本项目评估了NAT1敲低对乳腺癌细胞系蛋白质组的影响。这些组包括亲本MDA-MB-231乳腺癌细胞和两个增殖速率不同的独立NAT1敲除（KO）细胞系。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
