MAF 扩增赋予雌激素受体 α 驱动乳腺癌转移能力 [dataset 1]

该数据集来自 NCBI,对对照与 MAF 过表达的 MCF7 细胞进行 mRNA 表达谱分析,以评估在转移性 MAF 表达背景下雌激素受体(ER)激活的转录后果

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基因组回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA971172: MAF Amplification licenses Estrogen Receptor α to Drive Breast Cancer Metastasis [dataset 1]

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

MAF 扩增赋予雌激素受体 α 驱动乳腺癌转移能力 [dataset 1]

该数据集来自 NCBI,对对照与 MAF 过表达的 MCF7 细胞进行 mRNA 表达谱分析,以评估在转移性 MAF 表达背景下雌激素受体(ER)激活的转录后果。细胞在激素剥夺培养基中培养 72 小时,随后用 vehicle 或 ER-protac 处理 24 小时,再添加雌激素(E2)或 vehicle 6 小时后提取 RNA,样本设三个重复。数据可用于研究 MAF 如何支持转移相关基因表达、E2 与 ER 表达同早期和晚期基因反应及细胞周期调控的关联,以及 MAF 与 ER 依赖的基因反应,并揭示 MAF 表达导致 MCF7 细胞中 ER 介导转录事件的扩展(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们对对照和 MAF 过表达的 MCF7 细胞进行了 mRNA 表达谱分析,以评估在转移性 MAF 表达背景下,雌激素受体(ER)激活在存在或不存在 ER(使用针对 ER 降解的 protac)时的转录后果。为此,我们将 MCF7 细胞在激素剥夺(HD)培养基中培养 72 小时。此时,我们用 vehicle 或 ER-protac 处理细胞 24 小时,然后在 RNA 提取前加入雌激素(E2)或 vehicle 处理 6 小时。样本设三个重复。我们报告 MAF 支持参与转移功能的基因表达,并且 E2 处理和 ER 表达与 E2 早期和晚期基因反应及细胞周期调控相关。此外,还鉴定出一组 MAF 和 ER 依赖的基因反应。我们的结果表明,MAF 表达导致 MCF7 细胞中 ER 介导的转录事件扩展。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA971172

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数据说明

我们对对照组和MAF过表达的MCF7细胞进行了mRNA表达谱分析,以评估在存在或不存在ER(使用针对ER降解的protac)的情况下,转移性MAF表达后雌激素受体(ER)激活的转录后果。为此,我们将MCF7细胞在激素剥夺(HD)培养基中培养72小时。此时,我们用载体或ER-protac处理细胞24小时,然后在RNA提取前加入雌激素(E2)或载体6小时。样品一式三份制备。我们报告MAF支持参与转移功能的基因表达,并且E2处理和ER表达与E2早期和晚期基因反应及细胞周期调控相关。此外,还鉴定了一组MAF和ER依赖的基因反应。我们的结果表明,MAF表达导致暴露于E2的MCF7细胞中ER介导的转录事件扩展。总体设计:为了评估由MAF和雌激素受体(ER)调控的基因表达变化,将对照或MAF过表达的MCF7细胞维持在激素剥夺培养基中72小时。然后,加入ER-protac或载体24小时。

在加入E2或载体后的第二天,先处理6小时再进行RNA提取和mRNA分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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