PRJNA90165：乳腺癌他莫昔芬单药治疗全组织肿瘤活检数据集
该数据集来自 NCBI，收录 60 例 ER 阳性原发性乳腺癌患者，均接受他莫昔芬单药治疗 5 年，样本取自乳腺癌全组织切片
基本信息
资源简介
PRJNA90165：乳腺癌他莫昔芬单药治疗全组织肿瘤活检数据集
PRJNA90165 是一个聚焦乳腺癌内分泌治疗研究的转录组数据集，来源于 NCBI，收录 60 例雌激素受体（ER）阳性原发性乳腺癌患者，这些患者均接受他莫昔芬单药治疗并持续 5 年。数据集样本取自乳腺癌全组织切片，围绕乳腺癌、他莫昔芬与复发等关键词组织，主题标签为转录组或基因表达。该数据集可用于考察 ER 阳性乳腺癌患者在接受他莫昔芬单药治疗后基因表达层面的特征，为理解内分泌治疗背景下的肿瘤生物学表现提供数据基础。
【数据集背景】
乳腺癌是女性常见的恶性肿瘤之一，其中 ER 阳性亚型占相当比例，内分泌治疗是这类患者的重要治疗手段。他莫昔芬作为经典的雌激素受体调节剂，长期用于 ER 阳性乳腺癌的辅助治疗。该数据集正是围绕这一临床情境构建：60 例 ER 阳性原发性乳腺癌患者接受他莫昔芬单药治疗 5 年，研究者可借助转录组数据观察治疗过程中或治疗后肿瘤组织的基因表达状况，并关联复发等临床结局。数据集以“乳腺癌 / 他莫昔芬单药治疗（全组织肿瘤活检）”为英文名称，明确了其研究对象、治疗方式与样本类型。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“转录组或基因表达”，说明其数据主体为基因表达层面的测量结果。样本来自乳腺癌全组织切片，而非细胞系或分离后的单一细胞群体，因此保留了肿瘤组织的整体分子特征。源站描述中给出的样本关键词包括乳腺癌、他莫昔芬和复发，提示数据组织时围绕疾病类型、治疗药物与临床结局三个维度进行标注。数据覆盖 60 例患者，属于中小规模的临床相关转录组数据集。除上述信息外，具体的基因数量、测序平台、表达定量方法、临床变量字段等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），英文名称为 PRJNA90165: breast cancer / tamoxifen monotherapy (whole tissue tumor biopsies)。样本采集对象为 ER 阳性原发性乳腺癌患者，治疗背景为他莫昔芬单药治疗 5 年，样本类型为乳腺癌全组织切片。源站描述还标注了关键词“other”，表明其在源站的关键词分类中归入其他类别。关于样本采集的具体时间点、随访安排、伦理审批信息以及数据提交单位等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与 ER 阳性乳腺癌内分泌治疗相关的转录组研究场景，例如分析他莫昔芬单药治疗背景下肿瘤组织的基因表达特征、探索与复发相关的表达模式，以及作为乳腺癌公共转录组数据资源用于方法学比较或验证性分析。由于样本来自全组织切片，也适合关注肿瘤组织整体表达谱而非特定细胞类型的研究。需要强调的是，该数据集仅涉及他莫昔芬单药治疗情境，不涵盖其他内分泌药物或联合治疗方案。关于数据是否适合特定分析目的，源站未提供进一步说明。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI 获取该数据集，具体访问路径、下载方式与文件格式以源站提供的信息为准。由于数据集主题为转录组或基因表达，通常需要结合表达矩阵与样本注释开展分析，但样本注释的具体字段与格式源站未提供。使用时应留意样本关键词中“复发”等标注，以便在分析中区分相关临床分组；分组的具体定义与样本对应关系源站未提供。关于数据处理流程、标准化方法或推荐分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的样本量为 60 例，属于相对有限的规模，可能影响统计效力与亚组分析的稳健性。数据仅覆盖 ER 阳性原发性乳腺癌且接受他莫昔芬单药治疗 5 年的患者，适用范围具有明确的临床限定，外推到其他分子亚型或治疗方案时需谨慎。样本为全组织切片，表达信号可能混合多种组织成分。关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应以及随访完整性等，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，使用时应遵循源站的引用规范与数据使用条款。具体的文献引用信息、数据许可类型及使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA90165
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含60例ER阳性原发性乳腺癌患者且接受他莫昔芬单药治疗5年的数据集。数据来源于乳腺癌全组织切片。样本关键词：乳腺癌、他莫昔芬、复发 关键词：其他
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
