PRJNA90027:乳腺癌他莫昔芬单药治疗(显微切割肿瘤活检)
该数据集来自 NCBI,包含 60 例 ER 阳性原发乳腺癌患者,均接受他莫昔芬单药治疗 5 年,数据由 LCMed 癌细胞生成,涉及乳腺癌、他莫昔芬与复发等关键词,主题为转录组或基因表达

基本信息
资源简介
PRJNA90027:乳腺癌他莫昔芬单药治疗(显微切割肿瘤活检)
PRJNA90027 是一个聚焦乳腺癌内分泌治疗与复发问题的转录组或基因表达数据集,来源于 NCBI。该数据集纳入 60 例 ER 阳性原发乳腺癌患者,这些患者均接受他莫昔芬单药治疗,疗程为 5 年。数据由 LCMed 癌细胞生成,围绕乳腺癌、他莫昔芬和复发等关键词组织,可用于观察 ER 阳性乳腺癌在他莫昔芬单药治疗背景下的基因表达特征。整体而言,该数据集以临床治疗背景明确的患者队列为基础,主题集中在转录组或基因表达层面,适合作为乳腺癌内分泌治疗相关表达研究的参考数据资源。
【数据集背景】
该数据集关注 ER 阳性原发乳腺癌患者在接受他莫昔芬单药治疗后的基因表达情况。他莫昔芬是乳腺癌内分泌治疗中的常用药物,本数据集所对应的患者均接受该药单药治疗 5 年,因而其表达数据处于明确的治疗背景之下。数据集同时涉及复发这一关键词,说明其关注点不仅在于治疗本身,也涉及治疗过程中或治疗后疾病复发的相关问题。从分类上看,该数据集归入肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为转录组或基因表达,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据内容】
数据集英文名称为 PRJNA90027: breast cancer / tamoxifen monotherapy (microdissected tumor biopsies)。其核心内容为 60 例 ER 阳性原发乳腺癌患者的相关数据,数据由 LCMed 癌细胞生成。样本关键词包括 breast cancer、tamoxifen、recurrence,其他关键词标注为 other。主题标签为 Transcriptome or Gene expression,表明数据内容属于转录组或基因表达范畴。数据集名称中包含 microdissected tumor biopsies 的表述,指向显微切割肿瘤活检样本这一来源形式。除上述信息外,源站未提供更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。患者层面的事实为 60 例 ER 阳性原发乳腺癌患者,且均接受他莫昔芬单药治疗 5 年。数据生成自 LCMed 癌细胞。关于样本采集的具体流程、时间点安排、测序平台、文库构建方式等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签与样本关键词,该数据集可用于转录组或基因表达层面的分析场景,尤其是围绕 ER 阳性原发乳腺癌、他莫昔芬单药治疗以及复发相关问题的表达特征研究。数据集名称中提及显微切割肿瘤活检样本,提示其适用于关注肿瘤细胞表达信息的分析需求。关于具体分析类型、统计方法或验证用途,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用说明,包括数据下载方式、文件组织格式、预处理流程或分析建议等。使用者需依据 NCBI 平台的一般数据访问规则自行获取与处理,具体细节以源站信息为准。
【质量与限制】
该数据集的患者数量为 60 例,均为 ER 阳性原发乳腺癌并接受他莫昔芬单药治疗 5 年,样本背景相对集中。数据由 LCMed 癌细胞生成,名称中涉及显微切割肿瘤活检样本。关于数据质量评估、缺失情况、批次效应、随访完整性或复发结局的判定标准等,源站未提供。使用时应结合源站原始记录核实相关细节。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在引用或再利用该数据集时,应以 ncbi.nlm.nih.gov 上该数据集页面的正式说明为准。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA90027
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
60例ER阳性原发性乳腺癌患者的数据集,患者接受他莫昔芬单药治疗5年。数据由LCMed癌细胞生成。样本关键词:乳腺癌、他莫昔芬、复发。关键词:其他。
数据缺失?
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