SOX11 表观遗传激活与 DCIS 复发及进展为浸润性乳腺癌相关 [Nanostring]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA883756

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

SOX11的表观遗传激活与DCIS的复发及进展为浸润性乳腺癌相关。SOX11及其表观遗传调控因子可作为DCIS患者复发风险的预后标志物，且该风险独立于传统临床和病理特征。总体设计：采用NanoString nCounter分析系统，使用定制代码集，该代码集包含53个目标基因及5个管家基因，这些基因通常从公开可用的DCIS基因表达数据集中识别，并与Kessler乳腺癌数据集中的复发事件相关联。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。