PRJNA543828:冷大气等离子体(CAP)对MCF-7乳腺癌细胞的作用 [数据集 1]
该数据集来自NCBI,聚焦冷大气等离子体(CAP)对MCF-7乳腺癌细胞紫杉醇耐药性的影响。研究建立紫杉醇耐药MCF-7/TxR细胞,经CAP处理后恢复对紫杉醇敏感性达70%,并通过全基因组表达谱比较鉴定出86个显著变化基因,其中48个包括DAGLA和CEACAM1
![PRJNA543828: Effect of cold atmospheric plasma (CAP) in MCF-7 breast cancer cells [dataset 1]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/122215.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA543828:冷大气等离子体(CAP)对MCF-7乳腺癌细胞的作用 [数据集 1]
该数据集来自NCBI,聚焦冷大气等离子体(CAP)对MCF-7乳腺癌细胞紫杉醇耐药性的影响。研究建立紫杉醇耐药MCF-7/TxR细胞,经CAP处理后恢复对紫杉醇敏感性达70%,并通过全基因组表达谱比较鉴定出86个显著变化基因,其中48个包括DAGLA和CEACAM1。数据主题为转录组或基因表达,可用于分析耐药逆转机制、筛选相关基因及研究CAP在乳腺癌治疗中的应用(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):紫杉醇是乳腺癌治疗中广泛使用的治疗性化学药物,然而癌症复发仍是改善癌症患者预后的障碍。在当前研究中,冷大气等离子体(CAP)被检验其克服耐药性的潜在用途,其主要由活性氧和活性氮物种组成。在建立紫杉醇(Tx)耐药MCF-7(MCF-7/TxR)乳腺癌细胞后,将CAP应用于细胞,并从细胞和分子方面检验其对药物敏感性恢复的影响。MCF-7/TxR细胞通过CAP恢复了对Tx的敏感性高达70%。比较Tx耐药细胞及其CAP处理细胞之间的全基因组表达谱,鉴定出86个共同出现显著变化的基因。值得注意的是,48个基因包括DAGLA和CEACAM1,已知它们有助于获得
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA543828
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
紫杉醇是一种广泛用于乳腺癌治疗的治疗性化学药物,然而癌症复发仍是改善癌症患者预后的障碍。在本研究中,冷大气等离子体(CAP)被考察了其克服耐药性的潜在用途,其主要由活性氧和活性氮物种组成。在建立了紫杉醇(Tx)耐药的MCF-7(MCF-7/TxR)乳腺癌细胞后,将CAP应用于这些细胞,并从细胞和分子层面考察了其对药物敏感性恢复的影响。MCF-7/TxR细胞通过CAP恢复了对Tx的敏感性,高达70%。比较Tx耐药细胞与其CAP处理细胞之间的全基因组表达谱,鉴定出86个共同出现且显著变化的基因。值得注意的是,包括DAGLA和CEACAM1在内的48个基因,已知这些基因有助于Tx耐药性的获得,在两种细胞状态下表现出相反的表达。所选基因DAGLA和CEACAM1的蛋白表达水平通过CAP恢复至其亲本细胞的水平。
此外,MCF-7/TxR中DAGLA和CEACAM1的失调减轻了CAP恢复药物敏感性的效果。综上所述,CAP通过重置多个耐药相关基因的表达,抑制了Tx耐药MCF-7癌细胞的生长并恢复了Tx敏感性。这些发现可能有助于将CAP的应用扩展到Tx耐药癌症的治疗中。总体设计:对MCF-7、MCF-7和MCF-7/TxR以及CAP处理的MCF-7/TxR细胞进行全基因组表达谱分析。结果,冷大气等离子体对CAP处理的MCF-7乳腺癌细胞产生不同影响。从MCF-7和MCF-7/TxR以及CAP处理的MCF-7/TxR中提取总RNA。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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