PRJNA277461：MCF-7乳腺癌细胞系全长转录本
该数据集为MCF-7人乳腺癌细胞系的全长转录本测序数据，采用PacBio Isoform Sequencing（Iso-Seq）技术生成，旨在展示该技术的能力并鼓励研究者探索转录组中的可变多聚腺苷化、新转录本和融合基因等特征
基本信息
资源简介
PRJNA277461：MCF-7乳腺癌细胞系全长转录本
PRJNA277461 收录的是 MCF-7 人乳腺癌细胞系的全长转录本测序数据，采用 PacBio Isoform Sequencing（Iso-Seq）技术生成。该数据集的初衷是展示 Iso-Seq 技术在获取全长转录本方面的能力，并鼓励有兴趣的研究者利用这一转录组数据探索可变多聚腺苷化、新转录本以及融合基因等特征。数据在 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）发布，主题归类为转录组或基因表达，本站将其归入肿瘤 / 乳腺癌分类，适合作为乳腺癌细胞系转录组研究的参考数据。
【数据集背景】
MCF-7 是乳腺癌研究中广泛使用的细胞系模型。该数据集以 MCF-7 细胞系为材料，对其全长转录本进行测序，目的在于验证和展示 PacBio Iso-Seq 技术的能力。源站描述明确指出，测序工作是为了演示该技术在全长转录本获取方面的表现，并希望借此推动研究者深入挖掘该转录组数据中诸如可变多聚腺苷化、新转录本和融合基因等特征。因此，该数据集既具有技术示范意义，也为乳腺癌转录组研究提供了可直接利用的数据资源。
【数据内容】
该数据集的内容为 MCF-7 人乳腺癌细胞系的全长转录本测序数据，主题标签为转录组或基因表达。源站描述提到，数据可供探索的特征包括可变多聚腺苷化、新转录本和融合基因等。除上述内容外，源站未提供关于样本数量、测序通量、转录本数目等具体指标。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），数据集英文名为 PRJNA277461: Full-length transcripts of the MCF-7 breast cancer cell line。测序对象为 MCF-7 人乳腺癌细胞系，测序技术为 PacBio Isoform Sequencing（Iso-Seq）。关于样本制备、测序平台参数、数据处理流程等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组与基因表达相关研究，尤其适合围绕乳腺癌细胞系 MCF-7 开展的全长转录本分析。根据源站描述，研究者可将其用于探索可变多聚腺苷化、新转录本和融合基因等特征；同时，该数据也可作为了解 PacBio Iso-Seq 技术能力的示范性材料。其他具体应用场景源站未提供。
【使用方法】
源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA277461
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对MCF-7人乳腺癌细胞系的全长转录本进行了测序，以展示PacBio同工型测序（Iso-Seq）技术的能力，并鼓励感兴趣的研究人员探索该转录组数据集，以发现可变多聚腺苷酸化、新转录本和融合基因等特征。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
