小鼠自发性转移性乳腺癌原发肿瘤与肺转移的全基因表达谱
该数据集来自 NCBI，基于 JygMC(A) 细胞系的小鼠自发性转移性乳腺癌模型，包含原发乳腺肿瘤、肺转移灶、正常乳腺组织和正常肺实质共 28 个样本的基因表达数据
基本信息
资源简介
小鼠自发性转移性乳腺癌原发肿瘤与肺转移的全基因表达谱
该数据集来自 NCBI，基于 JygMC(A) 细胞系的小鼠自发性转移性乳腺癌模型，包含原发乳腺肿瘤、肺转移灶、正常乳腺组织和正常肺实质共 28 个样本的基因表达数据。研究通过 Partek Genomic Suite 6.6 进行四组两两比较，以 FDR 校正 p 值小于 0.05 且倍数变化大于 2 筛选差异基因，可用于探索乳腺癌肺转移的位点特异性分子基础及候选标志物（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：在本研究中，我们基于 JygMC(A) 细胞系这一临床相关模型，探索了乳腺癌向肺部发生位点特异性转移的分子基础。在本数据集中，我们纳入了来自 JygMC(A) 原发乳腺肿瘤、肺转移灶、正常乳腺组织和正常肺实质的表达数据。总体设计：共分析了 28 个样本。我们使用 Partek Genomic Suite 6.6（PGS，Version 6.6，Partek Inc.）进行了以下两两比较：PT vs. NMG；PT vs. LM；LM vs. NL；LM vs. NMG。选取 FDR 校正 p 值 < 0.05 且倍数变化 > 2 的基因。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptome or Gene expression。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA268496
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
在本研究中，我们基于JygMC(A)细胞系构建了一个具有临床相关性的模型，探讨了乳腺癌肺特异性转移的分子基础。在本数据集中，我们纳入了来自JygMC(A)原发乳腺肿瘤、肺转移灶、正常乳腺组织及正常肺实质的表达数据。总体设计：共分析了28个样本。我们使用Partek Genomic Suite 6.6（PGS，版本6.6，Partek公司）进行了以下两两比较：PT vs. NMG；PT vs. LM；LM vs. NL；LM vs. NMG。筛选标准为FDR校正p值< 0.05且倍数变化> 2的基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
