PRJNA197524：汉堡系列乳腺癌基因表达数据

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PRJNA197524：汉堡系列乳腺癌基因表达数据

PRJNA197524 即“Breast Cancer Gene Expression Data from Hamburg Series”，来自 NCBI，本站归类为肿瘤 / 乳腺癌。该数据集收录汉堡系列 74 例不同亚型乳腺癌患者的手术活检样本基因表达谱，样本为治疗前新鲜冷冻手术活检组织，采用 Affymetrix HGU133A 平台进行分析，主题属于转录组或基因表达。整体来看，该数据集以临床乳腺癌活检样本为对象，通过芯片平台获取基因表达信息，可用于观察不同亚型乳腺癌在转录组层面的表达差异，为乳腺癌分子分型及基因表达相关研究提供数据基础。

【数据集背景】

乳腺癌是具有明显分子异质性的肿瘤，不同亚型在基因表达层面存在差异。该数据集来源于 NCBI，英文名称为“PRJNA197524: Breast Cancer Gene Expression Data from Hamburg Series”，其设计目的是对来自汉堡数据集的不同亚型乳腺癌患者手术活检样本进行基因表达谱分析。源站描述表明，该研究关注乳腺癌患者活检组织的基因表达特征，样本覆盖不同亚型，属于转录组或基因表达主题。该数据集可为乳腺癌亚型相关的表达谱研究提供样本层面的数据支持。

【数据内容】

该数据集的核心内容是乳腺癌患者手术活检样本的基因表达谱数据。源站描述显示，共涉及 74 例来自汉堡数据集的不同亚型乳腺癌患者。样本类型为新鲜冷冻的术前治疗前手术活检组织，检测平台为 Affymetrix HGU133A。主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明数据反映的是转录组或基因表达层面的信息。除上述内容外，源站未提供关于具体基因数量、表达值形式、临床变量字段及数据文件组成的进一步说明。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。样本采集自乳腺癌患者的手术活检组织，且为治疗前获取的新鲜冷冻样本。源站描述明确说明这些样本来自不同亚型的乳腺癌患者，并在 Affymetrix HGU133A 平台上进行分析。该数据集因此属于以临床活检组织为材料、以芯片表达谱为检测手段的转录组数据集合。关于样本采集的具体时间跨度、机构伦理审批信息及样本纳入排除标准，源站未提供。

【适用场景】

基于其内容，该数据集适用于乳腺癌基因表达谱相关研究，例如不同亚型乳腺癌之间转录组表达特征的比较分析、基因表达层面的样本分组探索，以及与其他乳腺癌表达谱数据集的对照研究。由于样本为治疗前新鲜冷冻手术活检组织，也可用于关注治疗前肿瘤组织表达状态的研究场景。需要说明的是，上述适用方向依据数据主题与样本类型组织，源站未提供具体分析结论或验证结果。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI 来源站获取，具体访问与下载方式应遵循源站提供的指引。使用时应关注其平台为 Affymetrix HGU133A，样本为治疗前新鲜冷冻手术活检组织，共 74 例不同亚型乳腺癌患者。由于源站未提供数据处理流程、标准化方法及配套临床注释文件的详细说明，使用前需依据源站实际提供的数据文件进行确认。关于分析工具、参数设置及数据格式转换方式，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集样本量明确为 74 例，来源于汉堡系列，覆盖不同亚型乳腺癌患者，样本类型为治疗前新鲜冷冻手术活检组织，平台为 Affymetrix HGU133A。其限制在于，源站未提供样本临床特征的详细分布、随访信息、数据质控指标及批次信息，因而无法据此判断数据在亚型平衡性、样本质量及批次效应方面的具体情况。此外，源站未提供数据完整性或缺失情况的说明，使用时应结合源站原始记录进行核实。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于数据引用方式、原始文献出处及使用许可条款，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前，应查阅 NCBI 源站页面及相关记录，以确认适用的引用规范与许可要求。