PRJNA162571：MicroRNA-30c通过调控TWF1和IL-11抑制人乳腺肿瘤化疗耐药：MDA-MB231数据集
该数据集来自 NCBI，聚焦肿瘤/乳腺癌方向，主题为转录组或基因表达。源站描述围绕 miR-30c 通过直接靶向 TWF1 并涉及 IL-11 调控乳腺癌化疗耐药与 EMT 的分子机制展开，包含 MDA-MB231 相关数据
基本信息
资源简介
PRJNA162571：MicroRNA-30c通过调控TWF1和IL-11抑制人乳腺肿瘤化疗耐药：MDA-MB231数据集
PRJNA162571 数据集全称为 MicroRNA-30c inhibits Human Breast Tumor Chemotherapy Resistance by regulating TWF1 and IL-11: MDA-MB231 DataSet，来自 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），在分类上归属于肿瘤／乳腺癌方向，主题标签为转录组或基因表达。该数据集围绕 miR-30c 抑制人乳腺癌化疗耐药这一核心机制展开，涉及 miR-30c 直接靶向肌动蛋白转运蛋白 TWF1、进而影响上皮—间质转化（EMT），以及 IL-6 家族成员 IL-11 作为 TWF1 在 miR-30c 信号通路中的次级靶点等内容，并包含 MDA-MB231 相关数据。整体而言，该数据集为研究乳腺癌化疗耐药相关分子机制与基因表达变化提供了可用的转录组资源。
【数据集背景】
化疗耐药常常驱动肿瘤进展，但其潜在的分子机制此前研究得并不充分。上皮—间质转化（EMT）已被证明与治疗耐药相关，然而二者之间的功能性联系及信号通路仍待阐明。该数据集所对应的研究报道，人乳腺癌预后标志物 miR-30c 通过直接靶向促进 EMT 的肌动蛋白转运蛋白 TWF1，在化疗耐药中发挥关键作用；IL-6 家族成员 IL-11 被鉴定为 miR-30c 信号通路中 TWF1 的次级靶点。在临床肿瘤中，miR-30c 的表达与 IL-11 表达呈负相关，而 IL-11 与乳腺癌患者的无复发生存相关。该研究识别出一条调控乳腺癌化疗耐药的新型 miRNA 介导通路，有助于开发新的管理策略。
【数据内容】
该数据集的主题为转录组或基因表达，聚焦乳腺癌化疗耐药相关的基因表达信息，并以 MDA-MB231 相关数据为核心内容。结合研究背景，数据所覆盖的分子对象包括 miR-30c、TWF1 与 IL-11，以及它们所关联的 EMT 与化疗耐药表型。关于样本数量、测序平台、数据文件类型与具体表达矩阵等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），编号为 PRJNA162571。其源站描述围绕 miR-30c 通过直接靶向 TWF1 并涉及 IL-11 调控乳腺癌化疗耐药与 EMT 的分子机制展开，并明确包含 MDA-MB231 相关数据。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批及实验操作流程等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于乳腺癌化疗耐药机制研究，尤其是围绕 miR-30c—TWF1—IL-11 信号轴、上皮—间质转化与治疗耐药之间关系的研究；也可用于转录组或基因表达层面的差异表达分析与通路层面的探索性分析，以及乳腺癌预后相关标志物（如 miR-30c、IL-11）的验证性研究。关于其他疾病领域或非乳腺肿瘤场景的适用性，源站未提供。
【使用方法】
使用时应以转录组或基因表达数据的一般分析流程为基础，围绕 miR-30c、TWF1 与 IL-11 及其相关通路开展表达分析与机制解读。关于该数据集的具体下载方式、文件组织格式、预处理步骤与推荐分析参数，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI 公共数据库，其源站描述提供了研究背景与主要分子机制结论。关于数据质量评估指标、批次效应、样本量、测序深度及潜在偏倚等信息，源站未提供。使用者在解释结果时应注意，源站描述中的机制结论基于该研究自身的数据与实验体系，外推到其他细胞模型或临床人群时需谨慎。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），编号为 PRJNA162571。关于具体的引用文献、作者列表、发表期刊以及数据使用许可与再分发条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA162571
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
化疗耐药常驱动肿瘤进展，但其潜在分子机制尚不明确。上皮-间质转化（EMT）已被证实与治疗耐药相关，但其功能联系及信号通路仍有待阐明。我们在此报道，人乳腺肿瘤预后标志物miR-30c通过直接靶向肌动蛋白转运蛋白TWF1在化疗耐药中发挥关键作用，而TWF1可促进EMT。IL-6家族成员IL-11被鉴定为miR-30c信号通路中TWF1的次级靶点。在临床肿瘤中，miR-30c的表达与IL-11表达呈负相关，且IL-11与乳腺癌患者的无复发生存期相关。鉴定调控乳腺癌化疗耐药的新型miRNA介导通路将有助于开发新的管理策略。总体设计：MDA-MB231 30c vs. MDA-MB231 scrambled
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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