PRJNA1522262:不同乳腺癌亚型脑转移相关转录组特征
BioProject 汇集单一计划相关、来自单一组织或联盟的生物学数据,并为用户提供统一入口,链接该项目产生的多种数据类型

基本信息
资源简介
PRJNA1522262:不同乳腺癌亚型脑转移相关转录组特征
Transcriptomic Signatures Associated with Brain Me... (ID 1522262) - BioProject - NCBI
NCBI BioProject(ID 1522262)标题涉及 Transcriptomic Signatures Associated with Brain Me...(截断)。BioProject 汇集单一计划相关、来自单一组织或联盟的生物学数据,并为用户提供统一入口,链接该项目产生的多种数据类型。标签为 Transcriptome or Gene expression(来源 NCBI)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据,源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口,以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1522262
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1522262
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
脑转移是乳腺癌的一种重要并发症,其分子决定因素因乳腺癌亚型而异。本研究利用乳腺癌组织的RNA测序,探讨了与脑转移相关的转录组差异。已提交的RNA-seq数据集包含42个已分析的生物学样本,其中23个样本被分类为脑转移阳性,19个为脑转移阴性。研究采用差异基因表达和功能富集分析,以表征Luminal A、Luminal B、HER2富集型和三阴性乳腺癌亚型中与脑转移相关的转录程序。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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