HSD17B4敲除乳腺癌细胞的基因表达分析
其记录汇集与单一计划相关的生物数据，源自单一组织或联盟，并为用户提供统一入口，以查找该项目生成的不同数据类型。据此可用于定位与 HSD17B4 敲除相关的基因表达分析数据（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
HSD17B4敲除乳腺癌细胞的基因表达分析
Gene expression analysis of HSD17B4 knock-out brea... (ID 1516284) - BioProject - NCBI
该 BioProject（ID 1516284）来自 NCBI，标题为 Gene expression analysis of HSD17B4 knock-out brea...，标签为 Transcriptome or Gene expression。其记录汇集与单一计划相关的生物数据，源自单一组织或联盟，并为用户提供统一入口，以查找该项目生成的不同数据类型。据此可用于定位与 HSD17B4 敲除相关的基因表达分析数据（来源 NCBI）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据，源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口，以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptome or Gene expression。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1516284
下载信息
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数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1516284
标准获取流程：
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
当负责极长链脂肪酸和雌二醇过氧化物酶体β氧化的HSD17B4被甲基化沉默时，HER2阳性乳腺癌有很大机会达到病理完全缓解。在此，我们旨在阐明其潜在分子机制。我们进行了RNA-seq分析和基因集富集分析，以无偏倚地搜索由HSD17B4敲除驱动的基因。利用KEGG数据库对HSD17B4耗竭上调的通路进行分析，发现了一个与氧化磷酸化相关的基因网络；利用GOBP术语则发现了一个与线粒体呼吸链相关的基因网络。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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