基本信息

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基因组

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

冷大气等离子体阻止乳腺癌紫杉醇耐药发展

PRJNA1514644 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库中的生物项目，其英文标题为“Cold atmospheric plasma prevents the development of paclitaxel resistance in breast cancer”，中文可理解为“冷大气等离子体阻止乳腺癌紫杉醇耐药的发展”。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达相关。从标题和主题标签来看，该项目关注的是冷大气等离子体在乳腺癌治疗背景下与紫杉醇耐药形成之间的关系，并可能通过基因表达层面的数据来支撑相关研究。该记录来自 ncbi.nlm.nih.gov，属于 BioProject 体系下的一个具体项目条目，项目编号为 1514644。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种生物数据组织方式，用于汇集与某一项单一研究计划相关的多种类型生物数据。该计划通常来自一个机构或一个联合体。BioProject 记录的核心作用，是为用户提供一个统一的入口，以便查找该项目所产生的不同类型的数据。PRJNA1514644 正是这样一个 BioProject 条目，其研究主题聚焦于乳腺癌中紫杉醇耐药的发展，以及冷大气等离子体在阻止这一耐药过程中的潜在作用。紫杉醇是乳腺癌治疗中常用的化疗药物之一，耐药性的出现往往会影响治疗效果，因此围绕耐药机制及干预手段的研究具有明确的临床与基础研究意义。该数据集所属的肿瘤 / 乳腺癌分类，也进一步说明了其研究背景位于肿瘤学与乳腺癌治疗的范畴之内。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容与转录组或基因表达相关。这意味着该项目可能涉及对基因表达水平的检测与分析，用以观察在冷大气等离子体处理、紫杉醇耐药发展等条件下，乳腺癌相关样本中基因表达的变化情况。不过，关于具体的样本数量、测序平台、基因列表、表达量矩阵、差异表达分析结果等详细内容，源站未提供。因此，无法从现有信息中确定该数据集具体包含哪些文件类型、数据规模或分析层级。可以明确的是，作为 BioProject 记录，它旨在汇集与该项目相关的多种数据类型，而转录组或基因表达是其标注的核心主题方向。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，具体条目为 NCBI BioProject 下的 ID 1514644。BioProject 记录本身并不一定直接包含所有原始数据文件，而是提供指向该项目所产生的各类数据的链接。该项目的英文标题明确指向乳腺癌、紫杉醇耐药以及冷大气等离子体这三个关键要素。关于样本采集的具体方式、采集时间、采集地点、伦理审批信息、实验设计细节等，源站未提供。因此，无法进一步说明其采集流程或来源机构的详细信息。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于与乳腺癌紫杉醇耐药、冷大气等离子体干预、转录组或基因表达分析相关的研究场景。例如，研究人员可能利用该 BioProject 记录查找与乳腺癌耐药机制相关的基因表达数据，或关注冷大气等离子体对肿瘤细胞转录组影响的实验数据。由于主题标签明确指向转录组或基因表达，该数据集也可能适用于差异表达分析、通路富集分析、耐药相关基因筛选等常见转录组研究用途。但具体适用性仍需结合该项目实际释放的数据类型和实验设计来判断，源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

作为 BioProject 记录，用户通常可以通过 NCBI BioProject 页面访问该条目，并通过页面提供的链接跳转至与之关联的数据资源。具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、预处理步骤等，源站未提供。因此，无法给出针对该数据集的具体使用操作指南。一般而言，BioProject 的作用是帮助用户发现和定位项目相关数据，而非直接替代原始数据存储库或分析平台。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共生物数据资源体系的一部分。但关于该项目的样本质量、数据完整性、测序深度、重复次数、统计效力等质量指标，源站未提供。同时，该记录仅提供了标题、分类、主题标签和来源等有限信息，未提供详细的实验方法、数据分析结论或验证结果。因此，在使用该数据集时，需要结合其关联的原始数据和分析文档进行判断。当前信息不足以评估其质量水平或具体限制条件。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或授权要求，源站未提供。用户如需引用或使用该 BioProject 相关数据，应参考 NCBI BioProject 页面及其关联数据资源中给出的正式说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344114

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1514644

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

紫杉醇（PTX）耐药是乳腺癌有效化疗的主要障碍。冷大气等离子体（CAP）已显示出抗癌疗效，本研究检验了CAP预处理能否阻止PTX耐药性的产生。对MCF-7和T-47D乳腺癌细胞系进行反复PTX暴露循环以产生PTX耐药亚系（Tx），并设置一组平行细胞在每个PTX循环前接受CAP处理（TxCAP），以检验CAP是否阻断耐药性的发展；未处理的亲本细胞（NC）作为对照。对两种细胞系的亲本、Tx和TxCAP细胞进行了RNA测序（3’ mRNA-seq），每种均设生物学三重复，以表征PTX耐药及其被CAP预防所背后的转录组变化。该数据集使得能够比较乳腺癌细胞中与化疗耐药发展相关的基因表达程序与CAP介导的耐药抑制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别