PRJNA1512419：MCF-7乳腺癌细胞中UBE2C敲低与过表达的转录组分析
BioProject 汇集与单一计划相关的生物数据，来自单一组织或联盟；其记录为用户提供单一入口，以查找该项目生成的多种数据类型（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
PRJNA1512419：MCF-7乳腺癌细胞中UBE2C敲低与过表达的转录组分析
Transcriptomic profiling of UBE2C depletion and ov... (ID 1512419) - BioProject - NCBI
NCBI BioProject（ID 1512419）标题为“Transcriptomic profiling of UBE2C depletion and ov...”，标签为转录组或基因表达。BioProject 汇集与单一计划相关的生物数据，来自单一组织或联盟；其记录为用户提供单一入口，以查找该项目生成的多种数据类型（来源 NCBI）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据，源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口，以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptome or Gene expression。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1512419
下载信息
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数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1512419
标准获取流程：
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究探讨了MCF-7人乳腺癌细胞中与UBE2C缺失和UBE2C过表达均相关的转录组变化。研究包括两组独立的bulk RNA测序比较：一个CRISPR/Cas9来源的UBE2C缺失克隆及其相应的sgCtrl克隆，以及UBE2C过表达细胞及其匹配的载体对照。对于每种条件，均从三份分别培养的细胞制备物中独立提取总RNA，并在RNA提取后、文库制备前将其合并，从而每种条件获得一个合并的RNA-seq文库。因此，这四个合并文库代表两组独立的UBE2C扰动比较，而非独立测序的生物学重复。这些数据集旨在表征与UBE2C表达缺失和获得相关的转录程序，并支持后续靶向实验验证。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
