PRJNA1506811：抗Notch联合内分泌治疗通过增加DAXX抑制ER+乳腺癌干细胞

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1506811

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数据说明

ER+乳腺癌中内分泌治疗（ET）耐药由Notch信号通路介导，但抗Notch治疗的临床应用一直受限于缺乏预测性生物标志物。为识别Notch调控的生物标志物，我们开展了一项术前窗口研究，评估ET联合γ-分泌酶抑制剂（GSI）MK-0752的疗效。采用Affymetrix芯片和实时PCR检测肿瘤中的RNA表达。ET联合GSI较单用ET显示出更多基因表达下调。具体而言，DAXX、NOXA和LFNG RNA表达升高，另有十五个转录本表达降低。在机制上，GSI减少了Notch1在HES1、HEY2、HEYL、CCND1、MKI67和DAXX基因内CSL结合元件上的占据，并抑制癌症干细胞（CSC）达90–100%。这种抗CSC效应依赖于DAXX，而GSI处理或Notch1/4敲低增加了DAXX表达，提示Notch对DAXX的转录抑制。通过小鼠肿瘤异种移植研究，ET联合MK-0752使MCF-7肿瘤完全消退，其中DAXX高表达的肿瘤表现出更高的治疗敏感性。在临床上，DAXX高表达与改善的无复发生存期和总生存期相关。

本研究发现，在ER+乳腺癌中，抗Notch联合ET通过增加DAXX（一种有前景的预测性生物标志物）来抑制癌症干细胞。这些发现支持对增加DAXX表达的方法进行临床评估。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。