PRJNA1501359：用新型生物传感器小鼠与临床队列追踪CDK1动态以预测ER+乳腺癌对CDK4/6抑制剂敏感性
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1501359），主题为肿瘤/乳腺癌，聚焦于利用新型生物传感器小鼠与临床队列追踪 CDK1 动态，以预测 ER+ 乳腺癌对 CDK4/6 抑制剂的敏感性
基本信息
资源简介
PRJNA1501359：用新型生物传感器小鼠与临床队列追踪CDK1动态以预测ER+乳腺癌对CDK4/6抑制剂敏感性
PRJNA1501359 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的研究项目，其英文全称为“Tracking CDK1 dynamics with a novel biosensor mouse and clinical cohorts to predict CDK4/6 inhibitor sensitivity in ER+ breast cancer”。该项目在分类上归属于肿瘤／乳腺癌方向，核心关注点在于借助一种新型生物传感器小鼠模型以及临床队列，对 CDK1 的动态变化进行追踪，并以此预测雌激素受体阳性（ER+）乳腺癌对 CDK4/6 抑制剂的敏感性。项目主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其涉及转录组或基因表达层面的数据。作为 BioProject 体系中的一项记录，它为使用者提供了一个集中入口，用以查找该项目所产生的多种类型数据及其相关链接。
【数据集背景】
BioProject 是围绕某一项单一研究计划而建立的生物数据集合，这些计划通常来源于某一个机构或某一个联合体。BioProject 记录的设计目的，是为用户提供一个统一的位置，以便找到针对同一项目所生成的不同类型数据及其链接。PRJNA1501359 正是在这一框架下登记的项目，其研究背景落在肿瘤学与乳腺癌领域，具体聚焦于 ER+ 乳腺癌对 CDK4/6 抑制剂敏感性的预测问题，并引入新型生物传感器小鼠与临床队列作为研究手段，围绕 CDK1 动态展开追踪。
【数据内容】
该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容涉及转录组或基因表达相关信息。项目全称中提及新型生物传感器小鼠与临床队列，指向该项目可能同时涵盖动物模型与临床样本两个层面的研究材料。除上述信息外，关于具体样本数量、测序平台、数据文件类型、基因列表或表达矩阵等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1501359。BioProject 作为生物数据的集合性记录，其数据可能来自单一机构或联合体，并为用户汇集该项目下多种类型数据的链接。关于本项目的具体采集机构、采集时间、采集地点、伦理审批信息以及样本纳入与排除标准等，源站未提供。
【适用场景】
基于项目标题与主题标签，该数据集适用于与 ER+ 乳腺癌 CDK4/6 抑制剂敏感性预测相关的研究场景，也适用于围绕 CDK1 动态追踪、生物传感器小鼠模型以及临床队列开展的转录组或基因表达分析。研究人员可将其作为查找该项目下各类数据及其关联链接的入口。关于更细化的适用分析类型或推荐应用方向，源站未提供。
【使用方法】
作为 BioProject 记录，该项目为用户提供单一入口，用以定位并访问由该项目生成的不同类型数据及其链接。使用者可通过 NCBI BioProject 平台检索项目编号 1501359 或项目英文名称来获取该记录。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具或操作步骤，源站未提供。
【质量与限制】
BioProject 记录本身是项目层面的登记信息，用于汇集数据链接，而非直接等同于经过统一质控的分析结果。关于该项目的样本质量、数据完整性、测序深度、批次效应或任何质控指标，源站未提供。使用者在利用该项目数据时，应结合其原始数据来源自行评估适用性与可靠性。
【引用与许可】
关于该项目的引用方式、文献出处、数据使用许可或授权条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1501359
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
高危雌激素受体阳性（ER+）早期乳腺癌（EBC）目前采用内分泌治疗与细胞周期蛋白依赖性激酶（CDK）4/6抑制剂联合管理，反映出对侵袭性ER+疾病患者向靶向治疗策略的转变。高危EBC的关键标志物包括高肿瘤分级和淋巴结受累，但目前临床实践中尚无标准分子标志物用于筛选此类患者。在晚期阶段，ER状态仍是应用CDK4/6抑制剂和内分泌治疗的唯一分子决定因素。CDK1活性位于CDK4/6轴的直接下游，但尚未被研究作为ER+乳腺癌的预后标志物。在此，我们将转基因小鼠中Cdk1活性生物传感器的实时成像与临床队列的高分辨率分析相结合，确立CDK1作为疾病进展和治疗敏感性的决定因素。利用与MMTV-PyMT;MMTV-Cre模型杂交的Cdk1活性生物传感器小鼠，我们对乳腺病变进行成像，并实时可视化原位Cdk1在向浸润性导管癌（IDC）转变过程中的上调。
在临床上，我们发现pCDK1T161在IDC中特异性上调，而pCDK1Y15是1期疾病无复发生存期不良的预后指标。关键的是，我们揭示了CDK4/6抑制剂介导逃逸的动态机制。我们观察到，虽然CDK4/6抑制最初抑制CDK1，但活性在3天内通过适应性反应反弹。对NeoPalAna试验的分析表明，虽然新辅助palbociclib和anastrozole在全球范围内诱导动态CDK1调节，但无响应者的特征是在治疗期间未能完全抑制CDK1水平，或未能启动这种早期适应性反应。此外，我们在体内和体外模拟了CDK4/6抑制剂耐药性，发现CDK4/6抑制剂耐药细胞在体外恢复了基础CDK1表达，并且内分泌和CDK
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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